聚丙烯酰胺凝胶作为电泳支持物,有何优缺点
聚丙烯酰胺凝胶电泳用于分离蛋白质和寡核苷酸. 作用原理 聚丙烯酰胺凝胶为网状结构,具有分子筛效应.它有两种形式：非变性聚丙烯酰胺凝胶及SDS-聚丙烯酰胺凝胶（SDS-PAGE）；非变性聚丙烯酰胺凝胶,在电泳的过程中,蛋白质能够保持完整状态,并依据蛋白质的分子量大小、蛋白质的形状及其所附带的电荷量而逐渐呈梯度分开. 根据浙大哲博检测的分离经验,可以发现下列问题最为容易出现：
1. pH对整个反应体系的影响是至关重要的.SDS－PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris－HCL缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9；而电泳缓冲液使用的Tris－甘氨酸缓冲系统.在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低；而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动.由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压梯度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带.当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离. 2. 根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法：还原SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理. 3.聚丙烯酰胺的作用：丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关.4. 出现拖尾现主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的. 5.通常胶在30MIN-1H内凝.如果凝的太慢,可能是TEMED,APS剂量不够或者失效.APS应该现配现用,TEMED不稳定,易被氧化成黄色.如果凝的太快,可能是APS和TEMED用量过多,此时胶太硬易裂,电泳时易烧胶.
