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双链构象多态分析法介绍

2022.4.14

  双链构象多态分析(double -strand conformation analysis,DSCA) 是利用荧光标记引物,通过PCR 扩增出相关的研究片段作为荧光标记参照(fluorescence labeled reference,FLR)DNA分子。然后,用标记参照物FLR 分子与待测PCR扩增片段进行杂交。因为FLR 和样本核苷酸序列相似,杂交反应液中所有DNA的正链和反义链之间将形成双链结构。只有与带荧光标记的FLR 分子正链匹配的DNA双链,经过电泳后方可被DNA测序仪的激光检测系统所检测。所以,可检双链均有一样的FLR 正链,杂交双链的电泳迁移率可能相同,但是由于反义单链的差异双链变性程度的差异而最终造成电泳迁移率的不同。不像SSCP 技术,DSCA能够任意操纵变性双链的形成,选用不同的FLR可以达到难分样本的最佳分离效果。另外,通过调整FLR 和样本待测DNA分子的比例,可专一性增强杂交异质双链信号并减弱纯合双链信号。DSCA技术的优点还在于它依据样品经过固定检测仪的时间差,而非相同电泳时间迁移的距离差来判断突变的有无,这样就避免了诸如SSCP 等技术分析中因迁移速率差异而降低的泳动速度慢的条带检测率。另一方面,DSCA的有效检测片段长度可达1 kb。由于激光系统的介入,DSCA的灵敏度和上样量分别得以提高和降低,不到1 秒的泳动差异也足以检测。该技术已被成功地用于囊性纤维化基因(cystic fibrosis gene) 的4 种突变,以及HLA Ñ型基因中131 种等应基因的检测。

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