双方拟定的重点合作内容包括：建立重大和新发、突发传染病防控科技协作体系，共同推动干细胞和再生医学等研究和应用的发展，共同促进新药创新与临床研究的紧密合作，共建一批转化医学研究中心，共建精神和心理联合研究中心，共建营养与食品安全联合研究中心，共同推进生物医学工程与先进适用医疗器械产业发展，探索建立“预防为主、关口前移”的健康科学研究模式，共同推进“健康中国2020”战略实施和战略目标的实现。此次战略合作协议的签署将开启双方合作的新局面，推进和带动我国跨部门战略科技合作。
签约仪式后，双方领导还出席了中国科学院武汉郑店实验室奠基仪式。该实验室是由卫生部和中国科学院共建、共管的生物安全实验室，与法国等开展国际合作，建成后将为我国乃至全球新发传染病预防与控制和生物安全研究体系的建设提供科技支撑。