表观遗传之DNA甲基化(二)
二 DNA甲基化
DNA甲基化:DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的,从而产生5-甲基胞嘧啶(5-mC),在体细胞中,几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC,而在胚胎干(ES)细胞中,在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC作为表型和基因表达的主要表观遗传修饰的生物学重要性已得到广泛认可。
此外在人和小鼠组织以及胚胎干细胞中已经检测到一些新的修饰核苷酸:5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC),5-甲酰基胞嘧啶(5-fC)和5-羧胞嘧啶(5-caC)。在哺乳动物中,这些修饰的核苷酸可能是由5-甲基胞嘧啶的迭代氧化产生的,该酶是由TET酶家族介导的。
DNA甲基化在正常生物发育和高等生物的细胞分化中起着重要作用,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而调控基因性状的表达。 基因表达以及几乎所有类型的癌症的发展也与DNA甲基化有关, 例如,由于各种环境影响,甲基缺乏可能导致5-甲基胞嘧啶含量的总体下降(DNA低甲基化),并且已被提议作为多种生物过程(例如癌症)的分子标记。因此,DNA甲基化的研究目前也是热门的研究之一。
三 DNA甲基化研究产品推荐
说到DNA甲基化的研究,我们有DNA甲基化定量检测试剂盒和DNA甲基化修饰试剂盒,以及相关的抗体和应用于DNA甲基化研究的DNA样本提取试剂盒。今天先给大家推荐推荐DNA提取试剂盒与DNA甲基化定量检测产品。
【1】DNA样本提取试剂盒
Epigentek可提供相关的DNA准备试剂盒,DNA样品可以从细胞,组织和体液中制备,并且是大多数DNA甲基化应用和测定法中最常用的起始材料。高效,精确和高质量的DNA分离是成功进行基于DNA的实验的关键前提。
FitAmp通用组织切片DNA分离试剂盒Cat #P-1003 | FitAmp血浆/血清DNA分离试剂盒 cat#p-1004 |
FitAmp尿液DNA分离试剂盒
cat#p-1017 |
FitAmp血液和培养细胞DNA提取试剂盒 cat#p-1018 |
FitAmp凝胶DNA分离试剂盒
cat#p-1007 |
FitAmp石蜡组织切片DNA分离试剂盒 cat#p-1009 |
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形式 | spin column | spin column | spin column | spin column | spin column | spin column |
结合能力 | 5 µg | 5 µg | 5 µg | 5 µg | 5 µg | 5 µg |
回收率 | >70% | >70% | >70% | >70% | >70% | >70% |
起始材料 | 组织切片 | 血浆,血清或体液 | 尿液 | 血液白细胞或培养的哺乳动物细胞 | 低熔点琼脂糖凝胶 | 福尔马林固定,石蜡包埋的组织 |
输入量 | 低至1 ng | 低至1 ng | 1 ng to 2 µg | 1 ng to 4 µg | 1 ng to 1 µg | 1 ng to 2 µg |
时间 | 2h | 12min | 20min | 20min | <15min | 2h |
此外还有DNA定量、浓缩、纯化和水解试剂盒,有需要可咨询小艾哟。
【2】DNA甲基化定量检测试剂
MethylFlash甲基化DNA定量试剂盒(比色) Cat #P-1034 |
MethylFlash Global DNA甲基化(5-mC)ELISA简易试剂盒(比色) Cat #P-1030 |
MethylFlash Global DNA羟甲基化(5-hmC)ELISA简易试剂盒(比色) Cat #P-1032 |
MethylFlash 5-甲酰基胞嘧啶(5-fC)DNA定量试剂盒(比色) Cat #P-1041 |
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目的 | 比色法检测DNA中的5mC | 比色法检测DNA中的5mC | 比色法检测DNA中的5hmC | 比色法检测DNA中的5fC |
关键点 | 在主要期刊中被高度引用的方法 与HPLC-MS可比的结果 |
减少交叉变化并提高准确性 快速便捷的“一步式”测定反应 |
强大的第四代MethylFlash技术应用于5hmC研究 | 强大的MethylFlash技术应用于5fC研究 |
起始材料 | DNA | DNA | DNA | DNA |
输入范围 | 50-200 ng | 20-200 ng | 50-200 ng | 100-300 ng |
最佳输入量 | 100 ng | 100 ng | 100 ng | 300 ng |
总时长 | 4 hours | 2 hours | 2 hours | 4 hours |
检测阈值 | 200 pg of meDNA | 50 pg of meDNA | 10 pg of hMeDNA | 1 pg of fC DNA |
检测到的甲基化类型 | 5-甲基胞嘧啶 | 5-甲基胞嘧啶 | 5-羟甲基胞嘧啶 | 5-甲酰基胞嘧啶 |
特异性 | >1000:1 meDNA:unMeDNA | >1000:1 meDNA:unMeDNA | >1000:1 hMeDNA:unMeDNA | >1000:1 fC DNA:unMeDNA |
形式 | ELISA-like Microplate-based | ELISA-like Microplate-based | ELISA-like Microplate-based | ELISA-like Microplate-based |
咱们再来看看一两个产品的检测结果图吧:
p-1034
p-1030
上述介绍的都是比色法,此外,还有荧光法试剂盒供大家选择哟,感兴趣的可以联系小艾~~
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项目成果
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项目成果