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瞄准合成生物学 安捷伦授予刘陈立研究员“思想领袖奖”

2023.5.09

  近日,安捷伦在上海举办了“思想领袖奖颁奖典礼暨合成生物学创新应用研讨会”。安捷伦全球副总裁兼大中华区业务总经理杨挺将安捷伦“思想领袖奖”颁授给中科院深圳先进技术研究院刘陈立研究员。该奖旨在支持刘陈立研究员在合成生物学领域的开拓性研究,重点包括采用自下而上的方式理解生物基因回路,通过协同个体细胞功能特性构建可自我复制的合成细胞。

  安捷伦高级副总裁兼首席技术官 Darlene Solomon 博士在线上致辞并表示:“可以说,自人类发现 DNA 螺旋结构以来,合成生物学的快速发展正在掀起第三次生物技术革命。对于人类如何生产更具可持续性的产品,合成生物学这一革命性技术将带来深远影响。安捷伦一直关注于合成生物学领域,为以刘陈立研究员为代表的前沿研究人员提供支持,突出体现了我们的一贯承诺。”

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安捷伦全球副总裁兼大中华区业务总经理杨挺

为中科院深圳先进技术研究院刘陈立研究员

颁发安捷伦“思想领袖奖”

  安捷伦“思想领袖奖”是安捷伦在全球为生命科学、诊断学和应用化学领域的权威思想领袖的研究提供人力和物力的支持,致力于推动基础科学的长足进步。自该项目推出至今,已有包括刘陈立研究员在内的七位中国科学家获得此项荣誉。

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安捷伦全球副总裁兼大中华区业务总经理 杨挺

  在致辞中,杨挺表示,安捷伦“思想领袖奖”旨在全球范围内寻求顶尖学术研究人员,建立持久的协作研究关系,推动对于安捷伦乃至全球都至关重要的研究领域的发展。此时此刻感到无比荣幸,与在座各位共同见证又一位来自中国的科学家——刘陈立研究员荣获安捷伦“思想领袖奖”。安捷伦很荣幸能够为刘陈立研究员提供完整的解决方案,如基因研究解决方案、细胞分析解决方案、色谱和质谱解决方案等,助力刘陈立研究员加速实现在中国打造合成生物学研究创新生态系统的目标。

  刘陈立研究员现任中国科学院深圳先进技术研究院(SIAT)副院长,深圳理工大学(筹)学术委员会副主任,深圳合成生物学创新研究院(iSynBio)院长。

  刘陈立研究员的实验室致力于定量合成生物学研究,基于“定量解析、合成重构”的研究思路,聚焦复杂生物系统形成过程的基本原理,合成生物系统的理性设计原理等重要科学问题开展工作;其所带领的深圳合成生物学团队始终坚持面向世界科技前沿和国家重大需求,积极在重大原始创新、原创技术策源和关键核心技术突破等方面发挥作用,推动合成生物学领域技术水平和创新能力的不断发展,旨在补齐该领域基础研究的短板,克服研发过程中的固有挑战,不断完善“基础研究+技术攻关+成果产业化+科技金融”的全过程创新生态链。

  刘陈立研究员在发表获奖感言时也表示:“首先非常感谢安捷伦对我们中国年轻生命科学研究者的认可以及对合成生物学这样的新兴研究领域的重视。合成生物学始于美国,从2000年开始迅速发展,不仅在科学技术与工程、甚至是在产业方面赋能食品/农业/环境/医药/材料等多个领域,已经涌现出一系列初创公司。相信在安捷伦的支持下,我们期待能联合更多学者一起攻克合成生物学领域的研究难题,共同推动合成生物学研究取得关键性突破进展。”

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参加颁奖典礼的双方嘉宾合影

从左至右:安捷伦整机销售团队南区销售经理廖斌,安捷伦整机销售南大区销售总经理杨亮,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟研究员,刘陈立研究员,安捷伦全球副总裁兼大中华区业务总经理杨挺,安捷伦大中华区行业拓展与应用创新团队经理安蓉,安捷伦学术与材料行业拓展与应用创新团队经理冉小蓉博士

  颁奖典礼同期举办了“合成生物学创新应用研讨会”,来自安捷伦和中科院深圳先进院技术研究所刘陈立研究员和罗小舟研究员、以及安捷伦冉小蓉博士分别带来合成生物学领域的最新研究进展与应用解决方案。

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中科院深圳先进技术研究院副院长 刘陈立博士

报告题目:合成生物学科学前沿与产业发展

  合成生物学是面向国际科学技术的最前沿研究领域,2021年共有126位诺贝尔奖得主联名发文中提到的加速的科技革命,包括信息技术、人工智能和合成生物学,这些将影响就业和整体经济等,会带来颠覆性结果。Science杂志发表的125个重大科学问题中就有17个问题与合成生物学相关。美国合成生物产业的十大赛道涉及医疗、软件、消费品、生物工程自动化平台等。当前的合成生物全球市场的复合年均增长率达28%,国内的合成生物学产业投资数量与总融资规模也在不断攀升。

  国际上,各国提出的合成生物学线路大多聚焦于工程应用,没有提出科学问题。而在香山会议上,我国学者提出了其核心科学问题——生命功能跨层次涌现的原理。合成生物学是自下而上重构生命功能,理解生命跨层次涌现的原理,才能提高理性设计能力。理解生命功能涌现原理也面临着核心难点。研究团队提出新的科学研究范式,在通过自动化仪器设备提供大规模、标准化生物数据的基础上,采用“白箱+黑箱”的探索模式去理解并发现学科背后的理论,从而达到设计建造有序的群体空间结构。

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中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员 罗小舟博士

报告题目:高通量实验室自动化辅助的全通路进化

  天然产物蕴含着丰富的化学结构,研究团队开发了一种高通量实验室自动化辅助方法,通过自动化辅助的通路进化,使每一个酶在低拷贝数环境也能进行定向进化。该方法已验证自动化和人工实验结果相同,还能通过机器学习算法来进一步增加其产量。该方法也有一定的局限性,需要有高通量的产物检测方法,而采用基于Bravo的高通量样品前处理可实现高通量分析与检测。

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安捷伦学术与材料行业拓展与应用创新团队经理 冉小蓉博士

报告题目:多维度整合分析方案赋能合成生物学

  报告分为合成生物学与分析挑战、安捷伦合成生物学多维度分析解决方案、自动化整合方案的打造这三个方面。

  合成生物学是生物技术的第三次革命,其研究层次从认识生命、改造生命到创造生命。当前,合成生物学面临着目标产物、副产物及产率、底盘细胞分析等分析需求,以及多维度测试数据获取困难、衍生到不同领域的应用分析、标准化自动化和高通量等挑战。安捷伦众多产品线平台包括基因组学、色谱、质谱、微生物细胞分析及自动化产品等,为合成生生物学“设计-构建-测试-学习”研究模式各个环节提供多维度解决方案。提供从细胞工厂构建、工业发酵放大测试、产品质量保证整个价值链条全面的解决方案。

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  此外,在颁奖典礼现场,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所刘陈立研究员、罗小舟研究员以及安捷伦全球副总裁兼大中华区业务总经理杨挺,安捷伦大中华区行业拓展与应用创新团队经理安蓉,安捷伦学术与材料行业拓展与应用创新团队经理冉小蓉博士接受了媒体联合采访,分别从合成生物学的研究进展、双方的合作进展及未来合作方向等方面层层展开阐述。

  采访伊始,安捷伦全球副总裁兼大中华区业务总经理杨挺解释了安捷伦为何将“思想领袖奖”颁发给合成生物学领域的科学家。

  杨挺表示,安捷伦十分看好合成生物学领域的发展前景。生物科技领域的研究正在面临很多挑战,合成生物学技术不仅可以带来帮助,还会带动产业整体的发展,尤其是在医药、环境、化工等领域将大有作为和前景。

  杨挺强调,在合成生物学研究领域,刘陈立研究员是毫无疑问的“思想领袖”。深圳先进技术研究院已经建设了深圳合成生物研究重大科技基础设施,将助力整个行业的生态发展。通过跟刘陈立研究员和其团队合作,安捷伦期望推动合成生物学领域相关的技术创新和进步,同时希望借助深圳的合成生物大设施,让安捷伦的整体解决方案在合成生物学领域有更多的探索。总而言之,安捷伦希望能与刘陈立研究团队一起为合成生物学研究进步做出贡献。

  刘陈立研究员也介绍了其实验室的特有研究方向——定量合成生物学。

  他解释道,目前,定量合成生物学是自身研究的特色方向,并且已经在国际和国内知名学术期刊发布多篇署名文章。合成生物学诞生至今虽然已有二十多年,但仍是非常年轻的学科,而推动定量合成生物学更是一个新的交叉领域,是更年轻的方向,正处于初期的发展阶段。

  刘陈立表示,合成生物学未来发展的一个方向,就是走向定量,走向定量才能够反过来助推理性设计。所谓定量就是发现科学背后的原理——需要提高效率,需要发现原理,这才能够真正地推动科技进步。“我们需要动态地看待学科的发展。目前我们面临的情况是这样呈现的,但未来却有无限可能。”他强调道。

  安捷伦大中华区行业拓展与应用创新团队经理安蓉介绍了安捷伦与深圳先进院及刘陈立研究团队的合作和展望。

  安蓉讲到,多年前安捷伦就开始关注和投入合成生物学,安捷伦“思想领袖奖”已经颁发给国外几位合成生物学领域内的领军人物,包括James Collins、George Church、David Liu三位知名学者,而刘陈立研究员获得该奖,也是安捷伦关注和持续支持合成生物学领域研究的例证。她说,“近年来,我们看到合成生物学在产、学、研、用及投资等领域都保持高活跃度;其次,安捷伦的许多科研和企业终端用户也得到安捷伦合成生物学平台支持;此外,我们也看到:以合成生物学为底层技术的生物经济已经上升到国家策略的层面,因此安捷伦特别看好合成生物学行业。”

  安捷伦本身在这个领域具有一定基础,一方面安捷伦提供色谱/质谱/光谱等理化测试平台,另一方面还有基因组学和通过不断收购强化的细胞分析等产品组合,能为合成生物学研究与应用提供比较全面的工具与测试平台。此外,安捷伦十分关注实验室的自动化和智能化,这是我们从现在开始到不久的未来重要的聚焦和投入方向。合成生物学研究所需要用到的相关技术以及对自动化、高通量的需求也刚好非常契合我们关注的新方向。安捷伦也希望通过与刘陈立研究团队的合作中完善方案,并得到使用反馈,从而为我们更好的优化和研发新产品提供参考。

  对此,杨挺也补充道,安捷伦和刘陈立研究团队的合作不仅仅是基于目前安捷伦的所有平台展开。安捷伦和不同的合作伙伴开展了很多合作项目,也希望能够借助本次合作,让合作伙伴一起加入,为合成生物学研究构建一个大的生态,能够为学科发展多做一些贡献,能够推动这个行业的技术创新。

  刘陈立研究员详细分析了合成生物学作为一项底层技术的理念及其产业化进展等相关层面内容。

  刘陈立表示,合成生物学被认为将带来第五次工业革命,以及第三次生物技术革命。但实际上,合成生物学目前的研究进展和取得的成果还未能够掀起工业革命,但这些成果已经开始推动了产业发展。目前,在合成生物学领域还需要进一步提高效率,发现理论。

  刘陈立解释说,所谓效率的提高,就是我们希望引入自动化、引入大平台设施。无论是像罗小舟博士这样的科研团队,还是安捷伦都在努力实现效率的提高。另一方面,为了取得理论突破,我们现在提出定量合成生物学,以“白箱+黑箱”的探索模式去发现学科背后的理论。效率提高加上理论的突破,才有可能把大家美好的愿望:第五次工业革命——合成生物工业的革命带进现实。

  罗小舟博士也分享了在报告中提到的合成生物大设施平台,并介绍了其在合成生物学研究过程当中的核心技术和仪器设备等。

  深圳合成生物研究重大科技基础设施,是合成生物领域的领先大科学装置,为该领域在学术研究和转化应用上提供了工程化平台。其目的是将“设计+构建+测试+学习”流程环节浓缩成一个“App”应用。一方面,这个“App”可以向更大范围推广;另一方面,全国各地甚至全世界的科研工作者和企业都可以直接去使用这个“App”,从而能够帮到整个国内、乃至全世界的合成生物学的发展。

  罗小舟博士指出:目前,我们也正在牵头,对定量合成生物学这样非常宏大的科学问题开展研究。深圳合成生物研究重大科技基础设施也将支撑这样一个大科学计划的研究。

  罗小舟博士以制造飞机举例,介绍了合成生物学研究包含的“设计+构建+测试+学习”四个环节的工程学理念。制造飞机首先要画图设计环节,构想飞机应该是长什么样子,有哪些部件,如何组装;其次是构建环节,即开始制造飞机部件,直至总装;接着是测试环节,测试飞机能够承受的风力/升力;最后再通过分析和学习数据,再形成一个新的设计方案。这就是现在合成生物学基于仪器的研究范式。

  同理,对于合成生物学而言:

  · 设计环节的研究会更多地借助软件,这些设计软件又会严重依赖于现在一些仪器测量的一些结果,所以二者会形成一个联动。随着积累的测量数据越多,软件可能预测得越精准。

  · 构建环节涉及到对生命体的构建,如DNA/RNA的合成等。这个环节会引入大量不同的自动化仪器,包括细胞的转化,细胞的同步,细胞的生化分析等。

  · 测试环节应用一些常见的测试仪器和方案,包括安捷伦现在开发的基于质谱的方法,基于色谱的方法,基于组学的方法等。其中还会涉及一些简单的测量工作,比如用酶标仪测量荧光/紫外等。

  · 学习环节则依旧需要借助大量软件。

  罗小舟博士总结说:这四个环节涉及的是物理层面、仪器层面的应用。一方面,分析测试仪器需要更多地参与到构建环节;而在需要大量使用仪器的测试环节需要我们更快、更好地测试出结果。

  最后刘陈立研究员补充道:

  第一,回到科学本身,能够获得安捷伦“思想领袖奖”,看到安捷伦对基础、前沿的科学研究领域的重视,我非常激动。基础前沿科学问题得到解决,才能让合成生物学真正兑现大家对它的期望,才能创造生命,带来革命。

  第二,定量合成生物学研究绝非能够仅凭我们单一一所实验室来实现突破,而是需要许多的实验室加入,形成研究的合力。更高层面,还是期盼国内和国际同行们一起努力。综合而言,合成生物学是一个跨国界的大计划,目标很宏大,但是点滴的进步可能会带来巨大的收获。

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颁奖典礼结束后,参会嘉宾参观了安捷伦应用实验室

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