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酶标仪在植物领域的三种应用总结(二)

2020.4.21

三、利用酶标仪进行植物信号分析

除了一些常见分子的分析和定量之外,常见的植物信号,如报告基因、蛋白蛋白相互作用和 ROS 分析等,也都可以用酶标仪 进行高通量的分析。

3.1 报告基因分析

基于 β-葡萄苷酸酶 (β-glucuronidase) 的 GUS报告基因系统利用了在高等植物中 β-glucuronidase 表达和活性很低,是常见 的研究植物基因功能和活力的分析方法。基于不同的底物,GUS 报告基因可用多种方法学进行检测,包括组织染色法、光吸收法 和荧光法。在此主要介绍可用于荧光酶标仪分析的荧光法,其主要基于底物 MUG (4-methylumbelliferyl b-D-glucuronide),其 在 GUS 的作用下产生具有荧光的 4-MU (4-methylumbelliferone),可以进一步用荧光酶标仪进行分析。在进行荧光法 GUS 报告 基因检测时,通常需要 4-MU 标准品进行校准,同时 GUS 的活性还需要进一步使用总蛋白量来校准。此外,4-MU 本身容易降解, 因此使用时注意保护和有效期。

荧光法 GUS 报告基因系统在植物研究中的应用方向很多,其中包括特定的基因启动子活力在激素处理和压力情况下的变化 ( 图六,J Exp Bot. 2005  Mar;56(413):909-20. ) 和特定基因的过表达是否会影响靶基因启动子活力 ( 图七,Mol Plant. 2012 Sep;5 (5):1042-57. ) 等。 

图六 利用 GUS 报告基因检测不同激素 ( 上图 ) 和压力 ( 下图 )情况下基因启动子活力的变化。白框表示对照组,灰 线代表处理组。图片来源于文献:J Exp Bot. 2005  Mar;56(413):909-20.。酶标仪为 SpectraMax Gemini

图七 利用 GUS 报告基因检测 RAP2.11 过表达对 AtHAK5 启动子活力的影响。 图片来源于文献:Mol Plant. 2012 Sep;5(5):1042-57.。酶标仪为 SpectraMax Gemini

3.2 蛋白蛋白相互作用分析

信号转导研究中蛋白之间的相互作用 (Protein-Protein interaction,PPI) 分析是关键的一环,植物研究也不例外。现阶段, 研究植物体内体外的PPI的方式有很多种,包括免疫共沉淀、FRET等。在这我们主要介绍利用酶标仪的两个方法:基于荧光的 bimolecular fluorescence complementation (BiFC) 和基于化学发光的 Split luciferase complementation assay (SLC)。

BIFC 是基于对荧光探针如 GFP、YFP 的 N,C 端拆分并分别和需研究的 PPI 成员克隆在一起。存在相互作用的情况下,探针的 N,C 端接近,具有荧光属性 ( 图八 )。此时就可用荧光酶标仪高通量分析是否存在 PPI。BIFC 的优势是检测体内的PPI存在,同时 结合荧光显微镜还可分析PPI发生的位置 ( 图九,Plant Cell. 2014 Mar;26(3):1345-59. )。


图八 BIFC 原理,图片来源于网址:https://commons.wikimedia.org/wiki/file:BiFC_(details).png


图九 BIFC 应用案例,左图为荧光显微镜分析结果,右图为对应的酶标仪检测结果 ( 36 份独立样本 ), 图片来源于文献:Plant Cell. 2014 Mar;26(3):1345-59. 酶标仪为:SpectraMax M5

SLC 则是基于敏感的化学发光反应,原理和 BIFC 类似,不过不是拆分荧光探针,而是荧光素酶 ( luciferase,图十,上 )。 PPI 发生时,荧光素酶的 N,C 端接近,此时结合引入的底物就可以进行化学发光反应,获得的光信号就可以用酶标仪分析( 图十,中,下 (Plant J. 2007 Oct;52(1):185-95.;Mol Cell.2018 Feb 1;69(3):493-504.e6. )。由于是化学发光检测,SLC 不受植物自发荧 光的干扰,同时也更为灵敏,缺点是无法直观检测 PPI 发生位置。

图十 上,SLC 原理,中,SLC 检测流程,下,利用 SLC 检测候选蛋白之间的相互作用,以及免疫系统的激活对相互 作用的影响。上图和中图来源于文献:Plant J. 2007 Oct;52(1):185-95.。下图来源于文献:Mol Cell.2018 Feb 1;69 (3):493-504.e6. 酶标仪为配备化学发光功能的 SpectraMax 系列


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