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斑点杂交技术的方法和步骤

2022.11.28

斑点杂交是指将DNA或RNA样品直接点在硝酸纤维素滤膜上,然后与核酸探针分子杂交,以显示样品中是否存在特异的DNA或RNA。同一种样品经不同倍数的稀释,还可以得到半定量的结果。所以它是一种简便、快速、经济的分析DNA或RNA的方法,在基因分析和基因诊断中经常用到,是研究基因表达的有力工具。但由于目的序列未与非目的序列分离,不能了解目的序列的长度。尤其当本底干扰较高时,难以区分目的序列信号和干扰信号。

1、材料:待分析的DNA或RNA样品,已标记的探针。

2、设备:狭槽点样器,真空泵,恒温水浴,真空烤箱等。

3、试剂:

(1)100% 甲酰胺。

(2)甲醛(37%)。

(3) 20×SSC。

(4)0.1mol/L NaOH。

(5)硝酸纤维素滤膜。

(6)滤纸。

4、操作步骤:

(1) 10μl样品与20μl 100%甲酰胺、 7μl 37%甲醛、2μl 20×SSC混合。混合置于68℃,15分钟后置冰浴中。

(2) 用0.1mol/L NaOH清洗点样器,再用无菌水充分冲洗。将一张经20×SSC浸润的滤纸铺在点样器上,上面再铺上一张经20×SSC浸润1小时的硝酸纤维素滤膜,加盖并夹紧,接通真空泵。

(3) 用10×SSC清洗各样孔。在每一样品中加两倍体积的2×SSC,混合后加样于孔中。外围几个孔中加2μl染料定位,缓慢抽吸。每孔用1ml 10×SSC清洗两次。继续抽吸5分钟,吸干滤膜。

(4) 取出滤膜,夹在两张滤纸中间, 80℃真空烘干2小时。按上述Southern或Norhtern杂交所述的方法与放射性标记探针杂交。

[注意]

1、在放射自显影时应注意滤膜必须干燥,并覆盖上保鲜膜,否则,滤膜将与X-光片粘在一起,使以后的操作困难。

2、在杂交过程中,整个滤膜应一直是湿润的,不得干涸。


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