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真核细胞总RNA的分离提取

2020.9.07

RNA是基因表达产物,由以下几类分子组成,rRNA(占细胞总RNA的80%~85%)、tRNA和核内小分子RNA(占10~15%)、mRNA(占1~5%)。其中mRNA是分子生物学的主要研究对象,分离制备mRNA是克隆基因,分析基因表达以及建立cDNA文库的首要步骤。
真核细胞总RNA分离提取的目的是要获得高纯度的具有充分长度的RNA分子,包括RNA的纯度和完整性。RNA分离的关键是尽量减少RNA酶的污染。RNA酶活性非常稳定,分布广泛,除细胞内源性的RNA酶外,环境中也存在RNA酶。因此在提取RNA时,应尽量创造一个无RNA酶的环境,包括去除外源性RNA酶的污染和抑制内源性RNA酶活性。主要是采用RNA酶的阻抑蛋白RNasin和强力的蛋白质变性剂盐酸胍或异硫氰酸胍抑制内源性RNA酶,采用焦碳酸二乙酯(DEPC)去除外源性RNA酶。
一、RNA提取 的关键
真核细胞RNA的提取过程有四个关键点,即①样品(细胞或组织)的有效破碎;②有效地使核蛋白复合体变性;③对内源RNA酶的有效抑制;④有效地将RNA从DNA和蛋白混合物中分离;其中最关键的是抑制RNA酶活性。提取的RNA可以用于核酸杂交、cDNA合成以及体外翻译等。
二、组织RNA提取的基本步骤
1.仪器:匀浆器、低温离心机、离心管。

2.试剂:氯仿、75%乙醇、异丙醇、DEPC溶液、1%甲醛变性胶、37%甲醛、3%过氧化氢、甲酰胺、RNA上样缓冲液。
3.主要步骤
(1)取组织50~100mg,加0.8ml Trizol冲洗匀浆器,移入同一离心管,冰上静置5min。
(2)加0.2ml氯仿,充分震荡混匀,静置3min,4℃,12000g×15min离心。弃沉淀。
(3)取上清,加入0.5ml异丙醇,颠倒混匀。-20℃静置2h,4℃,12000g×10min离心。
(4)弃上清,取沉淀,加入1ml 75%乙醇溶液,漂洗沉淀,4℃,7500g×5min离心。
(5)弃上清,沉淀真空干燥10min。
(6)加40μl DEPC溶液,充分溶解RNA。
4.结果鉴定
(1)紫外分光光度计检测:取RNA溶解液,按一定比例稀释后,紫外分光光度计测定260nm、280nmOD值,计算OD260/OD280比值,如果比值在1.7~2.0:1之间,说明RNA纯度可。
标准样品当OD260=1时,RNA浓度约为40μg/ml,根据下述公式计算RNA浓度:RNA浓度(μg/ml)=OD260×稀释倍数×40。


(2)电泳检测:1%甲醛变性胶电泳观察RNA质量,电泳槽及制胶板先用3%过氧化氢浸泡过夜;制1%甲醛变性凝胶板:4.5μl RNA,2ul 5×甲醛胶电泳缓冲液,3.5μl 37%甲醛,10ul甲酰胺,离心混匀,65℃变性15min后,迅速置冰浴中;再加入2μl RNA上样缓冲液,离心混匀后上样,6V/cm电压,电泳1~2h;暗室内紫外光下观察,拍照;如果观察到清晰的18S、28S RNA电泳带,无大量小分子RNA,说明RNA无明显降解,样品-70℃保存备用。
三、注意事项
1、所有玻璃器皿160~180℃高温干烤6h以上,非耐高温器皿经0.1% DEPC液浸泡后,经高温(15磅,20min)处理灭活RNA酶,所用试剂均用DEPC水配制,然后高压处理。
2、实验用水要经DEPC处理,但含Tris的试剂不能用DEPC处理。
3、实验操作过程中要戴一次性手套,以避免RNA酶污染。


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