如今阿贡进行了众多跨学科的基础与应用科学研究，这些学科包括高能物理学、气候学、数学和计算科学和生物工业学等。目前，阿贡致力于能源、生物与环境以及国家安全三大主要研究领域：

　　能源：阿贡不断开发新的先进电池和燃料电池，新的电力生成和储存系统，以及新的能源交通系统，以增加美国的能源使用效率，扩大能源范围。阿贡还致力于核能的研究，为提高美国核反应堆的安全和寿命而工作。

　　生物与环境：阿贡建立了分子标尺、水文学、经济以及社会综合计算模型，以便通过宏基因组分析、蛋白质发现和区域气候预测来进行区域生态气候评估。

　　国家安全：阿贡致力于开发关键性安全技术，用于保卫美国国土安全以及减轻大规模意外突发事件带来的危害。阿贡提供科学决策，研究开发新的传感器和材料，以及网络安全技术，努力防止核扩散和大规模杀伤性武器扩散。

　　阿贡还设计、建造、运行和管理着许多科学和工程研究高端设施，如先进光子源、串列直线加速器系统、纳米尺度材料中心、电子显微中心和强脉冲中子源等。这些复杂而造价昂贵的设施都作为美国国家科学资源而加以管理，实验室也将这些设施向来自工业界、学术界，甚至其他国家的研究人员开放，然后根据研究成果是否公开发表等条件判断是否收取一定费用。