猴痘基因组研究公布：14种序列皆来源这里
对来自正在进行的全球爆发的猴痘病毒 (MPXV) 基因组的分析发现，这些样本聚集在一起，表明它们的来源单一。
根据世界卫生组织的数据，从今年年初到 6 月中旬，已有 2100 多例经实验室确诊的猴痘病例，其中大部分是自 5 月初以来报告的。其中 80% 以上的病例出现在欧洲，12% 出现在美洲，那里的病毒不是地方病，而且这些病例与流行地区没有已知的联系。
根据欧洲疾病预防和控制中心的数据，葡萄牙的研究人员现在已经对 2022 MPXV 进行了系统发育分析，发现该疫情可能与 2017/2018 年爆发的单一来源有关。尼日利亚。他们周五在《自然医学》杂志上还报道说，病毒样本似乎正在加速进化，可能受到宿主 APOBEC3 的影响，这是一类有助于抵御病毒的 mRNA 编辑酶。
“加速进化是一个观察结果，但我们还不知道这是如何发生的。在 2022 MPXV 中发现如此多的突变是非常出乎意料的，”里斯本国立卫生研究院的资深作者 João Paulo Gomes Doutor Ricardo Jorge 说在一封电子邮件中。
他和他的同事分析了他们于 5 月 19 日公开发布的首个 2022 年爆发的 MPXV 基因组，以及其他 14 个 MPXV 基因组序列，其中大部分也来自葡萄牙。
系统发育分析将 2022 年爆发的样本置于进化枝 3 中，即以前称为“西非”进化枝的部分。所有暴发样本都紧密聚集在一起，表明持续暴发的单一来源。
与此同时，暴发样本形成了一个分支，与 2018 年和 2019 年与英国、以色列和新加坡的病例相关的病毒不同，这些病毒本身源于 2017/2018 年尼日利亚的暴发。这向研究人员表明，2022 年的爆发可能是由于尼日利亚爆发的病毒持续传播和演变所致。
然而，2022 MPXV 与 2018/2019 病毒平均相差 50 个 SNP，Gomes 指出这比预期的要多得多。他说，对于这种类型的病毒，预计每年会出现一两个突变。由于 2022 MPXV 很可能是 2017/2018 年尼日利亚疫情的后裔——这导致了 2018/2019 年英国、以色列和新加坡的病例——预计会出现大约 5 到 10 个额外的突变，而不是 50 个。
“因此，毫无疑问，我们正面临着加速进化的局面，”戈麦斯说。
这些变化也倾向于遵循某种模式，将更多的腺嘌呤和胸腺嘧啶纳入已经富含 A/T 的病毒基因组，这表明人类 APOBEC3 系统可能参与了这种加速进化。
APOBEC3 是一种宿主抗病毒机制，可诱导病毒突变，但如果酶不能完全限制病毒，则可能导致超突变。 Gomes 指出，这种机制已经在 HIV 和 HPV 中得到描述。
“我们不知道后果，但我们知道，例如，这些突变中的 [一些] 正在影响与人类免疫系统相互作用相关的病毒蛋白，因此，假设免疫逃避机制不能完全被丢弃，”他补充道。
总之，研究人员表示，对暴发样本进行病毒基因组测序可能使科学家能够更好地了解 2022 MPXV 的传播方式，并深入了解控制这种传播的方法。 “我们将专注于识别和监测在持续传播过程中实时出现的突变，以便更好地了解宿主的适应情况，”戈麦斯说。
