2009年，中科院进一步成立“科教结合工作指导委员会”，负责全面指导全院的科教结合工作;同时设立科技英才班、联合共建项目、特聘教师岗位项目、研究生公共教学实验平台等四类科教结合教育创新项目，采用政策引导、项目扶持，对院属各单位发展前景良好、特色突出的科教结合项目进行支持。截至2011年，支持科教结合教育创新项目共36项，覆盖了中国科大、中科院研究生院22个主要院系和中科院33个研究所。
以科技英才班为例，该项目积极创新，深入改革生源、师资、培养模式、条件保障、制度创新和国际合作等，从中国科大录取新生或从大二学生中选拔有潜力的优秀人才，努力通过本、硕、博连读的长周期(本科4年+研究生4年)、两段式(课程学习+科研实践)培养模式，将他们培养成为国家未来科学与工程的领军人才。中科院已支持中国科大与相关研究所联合创办11个“科技英才班”，招收学生435人。
此次成立合肥物质科学与技术研究中心，是中科院在长期践行科教结合、教育创新的基础上，进一步推进“寓教于研”和科技资源开放共享，依托一流科学家团队、国际前沿科研项目、国家级科学与工程平台以及野外台站网络，构筑全国科教结合协同创新联盟的又一重要探索。