浅谈核酸与飞行时间质谱的“完美邂逅”
先声诊断的实验室近期很是忙碌，除了最近火遍全球的第四代测序—牛津纳米孔测序平台和大家熟悉的高通量测序等在如火如荼的运转之外，据说他们又引进了一个新的技术平台——MassARRAY®核酸质谱分析系统。
先声小编表示核酸？质谱？它俩居然能是一对儿？质谱在小编的印象里不是做蛋白和代谢的吗？它居然还能做核酸？
这到底是个什么样的平台，
小编准备带领大家一探究竟~
这是什么平台？
MassARRAY®核酸质谱分析系统，来自美国Agena Bioscience公司，它完美地整合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量、质谱技术的高精确度，以及生物信息智能分析的强大功能，是国际业界公认的高通量SNP基因型分析和DNA甲基化片段分析的黄金标准，同时也是大样本量验证的重要工具。
MassARRAY®核酸质谱是全球唯一应用MALDI-TOF飞行时间质谱进行基因序列全方位研究与临床应用的技术平台。
此系统的初始型号IMPACT DxTM仪于2014年6月12日获得美国FDA认证，成为世界上首台获批用于临床检测的DNA质谱平台，同时美国FDA还特许该技术作为二代测序仪illumina MiSeqDx的验证平台，以弥补第一代Sanger测序仪灵敏度不足的短板。另外，此系统的最新型号Analyzer 4也已申报美国FDA认证，预计2018年可获证应用。
Why先声选择它作为核酸检测仪器之一？
高灵活性：PCR反应条件均一化、检测试剂通用化。
实验多重性：SNP基因分型/突变检测10-40重/孔、高灵敏度液体活检8-10重/孔；节省样本用量。
高性价比：无需荧光标记，低成本定量分析。
全自动化：全程8小时，无数据分析门槛，全自动结果分析。
一套系统可处理多样化基因变异类型：SNP/Indel基因分型、基因融合、染色体结构变异、DNA甲基化分析、CNV基因拷贝数变异、QGE®基因定量表达等。
一套系统可实现丰富的临床应用：药物基因组学（PGx）精准用药指导、肿瘤基因突变检测、靶向药用药指导、肿瘤液体活检、甲基化肿瘤早期筛查、遗传病筛查、病原体多重检测及耐药分析、病毒分子分型等。
How实现低成本多重性检测、全自动化？
MassARRAY®核酸质谱分析系统进行SNP/Indel基因型分析时包含以下关键步骤：
高灵敏度多重PCR→高通量芯片上机→高精确度质谱分析→自动化报告生成
此系统不需要杂交，避免了耗时复杂的杂交流程；也不需要荧光标记，信号偏差显著低于定量PCR，保证了单孔多重反应的准确性和重复性，全程手工操作<30分钟；8小时出最终分析结果。
能为临床做什么？
此系统在临床应用的亮点颇多，主要有以下几个方向：
遗传药理学(PGx用药)：如波立维CYP2C19、华法林CYP2C9/VKORC1、他汀类用药ApoE/SLCO1B1、高血压用药等
遗传病检测：新生儿耳聋基因筛查、地中海贫血等各类单基因遗传病筛查等
肿瘤基因突变检测：肿瘤个性化诊疗等
稀有血型鉴定：分析复杂的Rh血型基因型
超高灵敏度突变检测：肿瘤液体活检，复发与耐药监测
样本鉴定和定量质控：高精度快速样本鉴定与定量
基于此系统开发的商品化试剂主要有以下几方面的应用：
iPLEX®：基因分型(PGx用药指导)、拷贝数变异、肿瘤体细胞突变分析
UltraSEEKTM：多重低频突变检测、肿瘤液体活检(高达0.1/%灵敏度)
EpiTYPER®：甲基化分析、肿瘤早期筛查
国内外应用态势如何？
美国：
LDT行业利用MassARRAY®核酸质谱分析系统来实现普及型药物基因组学PGx精准用药的临床检测服务已成行业共识，尤其在精神类药物、心血管类药物、阵痛麻醉类药物、抗肿瘤药物等领域最为突出。如，OneOme、Admera Health、Assurex Health及GeneAlign等。
2016年08月，美国基因检测公司Myriad Genetics以4.5亿美元收购Assurex Health公司的精神药物基因组产品线GeneSight，将药物基因组学PGx精准用药的临床应用推向了一个新的高潮。次年，2017年06月，Assurex Health和美国Agena Bioscience就“全面使用MassARRAY®核酸质谱分析系统进行GeneSight检测服务”联合发布战略合作公告：“鉴于MassARRAY®核酸质谱分析系统稳定、简便、性价比高，适合更快速、更大样本容量检测等诸多优势，Assurex Health全面使用该系统进行GeneSight检测服务，且截止于当前，已完成超过50万例GeneSight的样本检测”。
国内：
相比而言，我国在极度缺乏中国人群大样本基因组用药数据的前提下，中国药物基因组学PGx用药仅仅停留于“单药单基因、无临床用药随访”的初级层面，比如波立维CYP2C19、华法林CYP2C9/VKORC1、他汀类用药ApoE/SLCO1B1、高血压用药等，精准用药的理念和临床实践相对滞后。
