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细菌免疫系统中的Cas10如何区分敌军和友军

2018.12.04

  当外来异物对我们发起攻击时,免疫系统中的民兵分子就会火速应战。不过,在一片混战之中,这些民兵分子必须很小心,以免对自己的战友开火。从细菌到人类,各种生物体已经进化出特殊的机制来避免这种混淆。

  在洛克菲勒大学的一项新研究中,研究人员介绍了一种策略,细菌可以通过这种策略来区分自己的部队和恶意入侵者,比如病毒。这项发表在《Molecular Cell》上的研究表明,Cas10蛋白通常是无害的,但在面对外来入侵者时就会变成酶“刺客”。

  这项研究主要关注III型CRISPR系统。据通讯作者洛克菲勒大学的刘诗欣(Shixin Liu)博士介绍,对于其他系统,当靶序列上存在一个突变时,通常会失去免疫力,但对于使用Cas10蛋白的III型系统,即使靶序列上有多个突变,它仍然有效。

  与其他类型的CRISPR酶相比,Cas10对着相对广泛的靶点开火; 然而,它总是能避免伤害细菌自身的DNA。那么,III型复合物究竟是如何区分敌军和友军呢?

  于是,研究人员设法了解Cas10如何与不同种类的RNA发生相互作用,并利用单分子荧光显微镜来分析酶的动力学。他们发现,当Cas10遇到外来者的RNA时,酶的结构呈现出新的形态。此外,当Cas10在各种构象之间循环时,它间歇性地进入活跃状态,这使得酶具有DNA溶解能力。

  与此相反,当Cas10遇到自身的RNA时,这种酶则锁定在非活性位置,阻止了DNA的任何切割。刘博士表示,这些结果解释了III型系统如何避免自我毁灭的行为。 “我们不希望Cas10随意切割DNA。它的活动必须受到调控,”他说。“似乎这种酶只有从非活性位置上解锁时才能发挥作用。”

  研究人员还发现,当Cas10暴露于突变的外来者RNA时,这种酶只能弯曲成有限数量的活性形状。 随着Cas10的延展性降低,细菌对入侵者的免疫反应强度也随之降低。

  这些研究结果表明,强大的免疫反应取决于Cas10的活动能力:当酶能够自由伸展时,它会在活跃状态下保持更长时间,从而有更多时间去降解危险的DNA。刘博士还指出,即使酶的灵活性降低,它也不会完全丧失防御入侵者的能力。

  “这些结果表明,免疫力并不是二元的(有或无),”他说。“相反,当外源的RNA发生突变时,免疫力的强度也会逐渐变化。”

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