负链RNA病毒复制的主要步骤
有些ssRNA病毒，它们的遗传物质为正链RNA，可以行使mRNA的功能。一旦病毒颗粒中的RNA进入寄主细胞，就直接作为mRNA，翻译出所编码的蛋白质，其中包括衣壳蛋白和病毒的RNA聚合酶。然后在病毒RdRp（RNA指导的RNA聚合酶，即RNA复制酶）的作用下复制病毒RNA。RdRp同时具有解旋酶的功能，复制时以正链RNA为模板合成双链RNA（双链RNA容易被宿主细胞识别遭到降解，因此正链RNA病毒复制需要在内质网上形成的囊泡内进行）随后双链RNA解旋，正链RNA脱离RdRp，之后一直以负链RNA作为模板合成双链RNA随后再解旋，不断重复这个步骤就可以大量复制作为病毒遗传物质的正链RNA，最后病毒RNA和衣壳蛋白自我装配成成熟的病毒颗粒。这类病毒很多，如ssRNA、脊髓灰质炎病毒、鼻病毒、TMV等。
负链RNA病毒复制的主要步骤
还有另一类ssRNA病毒即负链RNA病毒复制的大致过程是：首先病毒通过其表面糖蛋白与宿主细胞的特异性受体结合，接着病毒囊膜与细胞浆膜（即通过不依赖于PH途径）或有酸性环境的核内体膜（PH依赖途径）融合后释放病毒核糖核蛋白复合体（RNP）至细胞浆，在转录过程中每一mRNA得以合成，而通过复制产生全长反义基因组RNA，使其作为病毒基因组RNA的模板。很多负链RNA病毒在感染细胞的胞浆中复制，而一些正粘病毒和布尼亚病毒在细胞核中复制。新合成的RNP复合体与病毒结构蛋白在细胞浆膜或高尔基体膜组装，然后释放新合成的子代病毒。它们的复制特点是病毒颗粒中的ssRNA病毒为负链，进入寄主后不能直接作为mRNA，而是先以负链RNA为模板由RdRp合成与负链RNA互补的正链RNA，再以这个互补的正链RNA作为mRNA翻译出遗传密码所决定的蛋白质。负链RNA病毒合成正链RNA时不会形成双链RNA,正链RNA合成后会立刻脱离负链。这类病毒称之为负链非侵染型病毒，如滤泡性口腔炎病毒、流感病毒、副流感病毒、莴苣坏死黄化病毒等。
此外，还有一类特殊的正链RNA病毒即反转录病毒。该类病毒通常引起人和动物的肿瘤，其中包括造成人免疫性缺陷症的艾滋病病毒、白血病病毒、肉瘤病毒等。在它们的髓核中携带反转录酶和整合酶，能使RNA反向转录成DNA，丰富和发展了分子生物学的中心法则。它们的复制有其特有的特点，一是单链RNA的基因组必须反转录成双链DNA；二是随后这种DNA必须整合到细胞DNA中；三是整合状态长期持续下去并传给子代细胞，也可能转录RNA，生产子代病毒或使细胞转化；四是感染细胞不会死亡，分裂不停止。也就是说这类病毒的潜伏期很长，有时可以终身带毒而不发病。
