生物质谱技术用于蛋白质组学研究

  蛋白质组学研究的一般流程蛋白质提取、蛋白质分离、最后质谱鉴定。整个流程中还运用了Bottom up技术或Top down 技术。

  其中Bottom up技术会将蛋白质进行酶切,将蛋白质切成不同的肽段最后送入质谱鉴定。采用该技术样品分析通量高、分子量小容易分析。近几年来Bottom up技术发展迅速并逐渐趋于成熟。

  Top down 技术则没有酶切的过程,它是对整个蛋白质分子进行鉴定,虽然在通量上、数据处理上不能与Bottom up技术相比,但是对于保护整个蛋白质分子的完整性、蛋白质翻译后修饰基团上具备自己的优势。

  生物质谱解析蛋白质组学基本流程

  紧接着唐老师以Bottom up技术为例重点介绍了生物质谱解析蛋白质组学基本流程。首先将得到的生物复合物进行酶解,形成一些具有特征性的肽段,然后将肽段复合物送入质谱分析。如果肽段复合物比较复杂,送入质谱前还可以对其进行一维液相色谱分离再经质谱鉴定,从而得到肽段的一级质谱图或二级质谱图。最后根据算法处理对应到酶解的特征肽段,经数据库比对得到蛋白质分析数据。