这种差异通常不会造成“歧义”，但有时候，一“字”之差就让不同版本的书籍意义相左。在大豆中，大约1000多个“文字”中就存在1个“文字”的差异。这些SNP细小的差别，就可能导致某品系的大豆与众不同，或产量高于同类，或产量严重不足。

　　为了打开SNP的“潘多拉魔盒”，目前普遍使用“重测序”的方法。该方法是指通过核酸测序仪，对已知基因序列的基因组再进行一次测定，并对单个或者多个品种进行分析，得到SNP、PAV（获得和缺失变异）等遗传信息的技术。

　　当前，随着测序成本的降低，“重测序”已经成为动植物育种研究中便捷而有效的方法。而今年1月份，第一张豆科植物完整基因组序列图谱的公布，使得大豆“重测序”成为可能。

　　在“重测序”基础上，华大基因研究院的研究人员通过自主研发的SOAP denovo软件，分别对野生大豆和栽培大豆的测序数据进行组装拼接，除得到大量SNP外，还发现了栽培大豆获得或丢失的野生大豆基因。