普通PCR的优点和缺点
经典方法，国际和国内标准齐全
仪器试剂成本较低
PCR产物可以回收后做其他分子生物学实验
普通PCR的缺点
容易污染
操作繁琐
只能定性分析
敏感性中等
存在非特异性扩增，当非特异条带与目的条带大小一样时无法区分基于毛细管电泳的PCR。
针对普通PCR的缺点，一些厂家推出了基于毛细管电泳原理的仪器，将PCR扩增后电泳的步骤在毛细管中完成，灵敏度更高，可以区分几个碱基的差异并且通过MAERKER可以计算出扩增产物的含量。缺陷是仍然需要将PCR产物打开后放入仪器，仍然存在很大的污染风险。
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