随后，专家分为四个分组，对同步辐射在生命科学与高分子材料、物理与环境科学、材料与能源科学、先进成像与工业应用等学科领域的国际发展状况、国内用户需求和未来的线站建设进行了交流，并提出了意见和建议。专家充分肯定了上海光源二期工程的总体规划和考虑，完全支持在新建线站的同时开展用户支撑设施的建设。与会专家还提出了许多宝贵建议，如：动态成像光束线需求量很大，应建专用线站;通用蛋白晶体学线站不能满足国内用户需求，应考虑增加;学科目标方面，应进一步加强对国防、产业等国家需求方面的考虑，不能仅关注基础研究等。