据该工程依托单位中国农科院介绍，工程总投资1.7亿余元，2005年竣工并投入试运行。自投入使用以来，创新管理运行机制，聚集优秀人才，积极参与国内外合作与交流，全面实现了大型仪器设备、信息和资源的开放共享，每年接纳客座研究人员近500人，主要仪器设备实现24小时运行，共享率超过90%，为国内外提供各类分析测试服务50万余次，提供技术咨询5万多次，每年向60万人次提供资源信息服务，向全国1000余个单位提供农作物优异种质/亲本4万余份。

　　工程围绕国家粮食安全等重大需求，获得了种质资源评价创新利用、小麦品质评价体系、矮败小麦、转基因抗虫棉、高产抗虫三系杂交棉、高产大豆、转植酸酶基因玉米等一批标志性成果。先后获国家科技进步一等奖3项、二等奖5项;审定水稻、小麦、玉米、大豆、棉花等新品种95个，获新品种权26个;申请ZL158项，获授权ZL81项;在核心期刊发表论文1958篇，其中SCI收录543篇，出版著作131部。工程已建设成为我国农作物基因资源与基因改良学科发展基地、技术创新基地、高级人才培养基地与国内外学术交流基地。