谢晓亮等通过研究，揭示了上述预期的别构效应确实存在于双链DNA中。研究人员在一段DNA双螺旋上设计了两种蛋白分子的结合位点，并且调节其间DNA的长度。通过单分子全内反射荧光显微镜可以观察荧光标记的单个蛋白分子从其DNA结合位点上掉下来的速率，从而测定该蛋白分子对于此位点的相对结合能力。实验表明两个不同的DNA结合蛋白可以影响各自对DNA的结合能力，而且其变化随两个蛋白之间DNA链的长度同时增强或变弱，呈现出一种周期性，这个周期大约是10个碱基对，正好是DNA双螺旋的一个周期，并且这种效应的大小会随着两个蛋白之间的距离增加而衰减。
研究人员进一步通过各种对照实验及分子动力学模拟计算，确认了这种效应不是其它因素(如蛋白-蛋白相互作用、静电相互作用等)造成的，而是由蛋白质结合到DNA上导致的DNA双螺旋的构象变化即DNA的别构效应引起的。
DNA别构效应比较大，约有5倍左右，而这种效应因为传统的系宗实验不够精确而一直无法被测得。此外，DNA的别构效应是DNA的一个基本性质，不依赖于蛋白质的性质及种类。由于很多DNA结合蛋白，如转录因子和RNA聚合酶等在DNA上经常结合地较近，并协同行使功能，所以现在需要在理解基因调控的时候考虑这一效应。该项工作会还证明了DNA别构效应的确可以在活细胞内影响基因表达，所以这种效应在生理上是重要的。《科学》杂志在同期述评中也指出，这种通过双螺旋DNA导致的别构效应对于基因调控具有深远意义。