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Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片
2012年11月6日，来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码：AFFX)推出了 Axiom® miRNA靶基因分型芯片，唯一一款可在全基因组范围评估microRNA(miRNA)靶基因位点的高密度基因分型工具。这些新的芯片将实现全面研究，以阐明miRNA调控机制中的基因组变异如何影响基因表达和疾病风险。它检测在miRNA级联放大反应中的238,000个SNP和插入缺失，包括 miRNA、它们的mRNA靶基因位点以及沉默机制。
上个月，DNA元件百科全书(ENCODE)联盟(由美国国家人类基因组研究所资助的研究小组国际合作)报道了激动人心的数据，颠覆了人类基因组的大部分是“垃圾”DNA的观点。研究已证明，这些非编码遗传内容在复杂疾病中发挥的作用比之前想象的更大。“我们如今意识到这一部分非编码DNA与蛋白翻译调控高度相关，在健康和疾病中扮演重要角色，”Affymetrix遗传分析和临床应用业务部门的执行副总裁Andy Last博士谈道。“这些新的芯片作为功能强大的工具，能够对这些重要的可能参与复杂疾病的miRNA调控单元开展大规模的基因组分析。”
这些基因分型芯片将与Affymetrix的一整套miRNA表达分析产品互补，包括GeneChip® miRNA 3.0 Array、QuantiGene® 2.0 miRNA Assay以及QuantiGene® ViewRNA原位杂交(ISH)细胞分析，这些实现了全面完整的分析，以加深我们对健康和疾病中基因调控作用的了解。新的Axiom® miRNA靶基因分型芯片中超过80%的内容未出现在其他广泛使用的基因分型芯片上，让科学家能就这一重要的新内容来研究他们的样品队列，并补充他们现在通过荟萃分析开展的关联研究。
南加州大学Keck医学院USC Norris综合癌症中心的主管Stephen B. Gruber教授谈道：“我们利用Axiom® miRNA靶基因分型芯片开展的研究显示出有希望的结果。我们相信，这款以检测miRNA调控机制中的变异为重点的芯片代表了一个新机会，可广泛检测与癌症研究相关的一类重要变异。”
除了预设计的目录版本，客户也能够轻松选择他们自己的内容，添加到Axiom® miRNA靶基因分型芯片上，包括长的非编码RNA中的变异，用于疾病关联研究。
使用这款新芯片的初步研究已在美国人类遗传学协会(ASHG)的2012年度会议上展示。Affymetrix分子遗传学的高级总监Michael Shapero博士发表演讲，题目为“德裔犹太人群体中microRNA靶基因位点多态性和大肠癌的病例对照研究(Case-control study of microRNA target site polymorphisms and colorectal cancer in the Ashkenazi Jewish population)”。
Axiom® miRNA靶基因分型芯片目前接受订购，可在4-6周内发出芯片的定制版本。
