作为对国际生命条形码联盟这一建议的回应，2009年8月起，在中国科学院大科学装置开放研究项目“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”的支持下，中国科学院昆明植物研究所李德铢研究员联合全国19个科研院所和高校62名研究人员组成的“中国植物条形码研究团队（China Plant BOL Group）” (名单见http://english.kib.cas.cn/images/2011-10-28.pdf)，深入开展了种子植物DNA条形码的研究。研究团队根据对主要来自中国的种子植物75科141属1757种共约6286个样本（每个种至少2个样本）的四个DNA候选条形码片段（rbcL, matK, trnH-psbA和ITS）引物通用性、序列质量和物种分辩率等的综合分析，发现三个质体DNA候选条形码片段具有较高的通用性；核糖体核DNA候选条形码ITS在被子植物中的通用性较高，而在裸子植物中稍低。研究还发现，ITS具有最高的物种分辩率，与三个质体DNA条形码片段的任何一个组合均可分辨69.9-79.1%的物种，显著高于rbcL +matK条形码组合49.7%的分辨率。此外，ITS的部分序列ITS2也表现出较高的物种分辨率。因此，研究团队建议将ITS作为种子植物的核心DNA条形码（rbcL+matK +ITS)，同时强调了利用多个样本取样和不同遗传方式的DNA片段开展植物DNA条形码研究的重要性。