此外,本研究发掘出1,057,018个SNPs, 99,948个1-10bp 小片段缺失(Indels),16,487个大片段PAV(presence/absence variations)和17,111个拷贝数变化(CNVs)。这些结果对下一步深入研究基因组变异如何影响生物学性状,建立基因-性状关联和开展高粱分子育种有很大帮助。

  上述研究结果已于11月21日在线发表于Genome Biology (Doi:10.1186/gb-2011-12-11-r114)。景海春研究组助理研究员郑雷英和华大基因研究院的研究人员为该论文的共同第一作者。该研究得到了中科院知识创新工程重点方向项目和新加坡淡马锡研究所的支持。 

  

  高粱基因组遗传变异图示。该图显示高粱基因组中SNP、Indel、PAV和CNV在10条染色体上的分布,图中还显示了基因的分布。Ji2731、Keller和E-Tian为3个重测序的高粱品种。