六种exRNA货物类型被揭示
在一项新的研究中，为了开发由胞外RNA（extracellular RNA, exRNA）介导的细胞-细胞通讯图谱，美国国家卫生研究院（NIH）胞外RNA通讯联盟（NIH Extracellular RNA Communication Consortium）创建了exRNA图谱资源（https://exrna-atlas.org）。相关研究结果发表在2019年4月4日的Cell期刊上，论文标题为“exRNA Atlas Analysis Reveals Distinct Extracellular RNA Cargo Types and Their Carriers Present across Human Biofluids”。
图片来自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.02.018。
这种exRNA图谱版本4P1包含来自19项研究的5309个exRNA-seq和exRNA qPCR图谱，以及一套分析和可视化工具。
为了分析这些图谱之间的差异，这篇论文的作者应用计算反褶积方法（computational deconvolution）。这种分析产生了一种具有六种exRNA货物类型（CT1，CT2，CT3A，CT3B，CT3C，CT4）的模型，每种类型都可在多种人体生物体液（血清，血浆，脑脊髓液，唾液和尿液）中检测到。其中的五种exRNA货物类型与已知的囊泡和非囊泡（脂蛋白和核糖核蛋白）exRNA载体相关。
为了验证这种模型的效用，这些作者通过反褶积方法重新分析了一项运动反应研究，鉴定出之前未检测到的生理学相关的反应途径。为了实现这种模型的广泛应用，作为exRNA图谱资源的一部分，他们还提供了对用户提供的病例对照研究进行反褶积和分析的工具。
