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wb 蛋白在重复实验时还需要煮吗

2021.8.18

蛋白样品的制备是蛋白质组研究的第一步,无论后续采用怎样的分离或鉴定手段,样品制备都是关键步骤。因此,为了完全分析所有的细胞内蛋白,组织与细胞必须进行有效的破碎。本文在此介绍几种较为常见的方法。

变性条件——SDS LB直接裂解:
用常温或者高温预热过(预热更有利于阻止蛋白水解或者磷酸酶去磷酸化,但容易遗忘,而LB久煮会改变某些性质)的1*SDS LB(或者略高1.5*)直接加到细胞或者组织上并煮样。

通常6孔板细胞80%以上密度,需200ul,其他按平板面积比类推。通常条件下,SDS LB都是过量的(因此不一定要严格参考SDS LB稀释比);如果SDS LB不够,样品核酸、蛋白浓度过高时,煮样后会发现tip吸不上来,非常粘、一砣一砣的,很容易堵住tip。

这时候常规做法有两种:

1.再煮5min。常规煮样时间3-5min,样品过浓时就煮10min;

2.如果10min煮样后,仍然吸不起来,才适当增加SDS LB,继续煮; 也可以对样品进行超声。煮样时间若过长,蛋白会凝固,此时以失去继续WB的意义,请丢弃(判断标准:出现明显的蛋白沉淀和水分层)

此方法的缺点是:SDS LB煮过的样品如果用来做IP,需要特殊方法,因此,这种制备方法制备的样品有使用局限。

非变性裂解法:
裂解细胞请尽量冰上操作,减缓酶解作用。

裂解液配方是:20mM Tris/HCl, pH7.6, 100mM NaCl, 20mM KCl,1.5mM MgCl2, 0.5% NP-40 and protease inhibitors (20μg/ml leupeptin,10μg/ml pepstatin A and 10 μg/mlaprotinin)(此裂解液可用于抽提核蛋白),其中蛋白酶抑制剂可用0.5mMPMSF替代;如果还要做磷酸化蛋白,加1mM Na3VO4(现加现用),10 mM NaF, 1 mM Na3VO4, 50 mMbeta-GP。

此方法的优点:NaCl浓度略低于生理状态,保证裂解细胞的方式较为温和,便于随后的IP等试验。其他Na盐浓度的细胞裂解液也很常见,诸如0.15M(生理盐浓度)、0.3M、0.6M(高盐系列,裂解细胞时染色体会析出,细胞碎片和沉淀非常粘稠)及0.8-1.2M;0.3M及以下适合 IP试验,0.6M及以上适合纯化蛋白,尤其相互作用较强的复合体,要得到纯化的一些复合体的组成蛋白一般采用极端的高盐裂解细胞。

组织块裂解:
组织块较大用匀浆的方法最合适,现在有不少转头很小的匀浆器。

当组织超微量的时候,比如50mg新鲜癌组织,建议采用的方法是

1. 低温(剪)搅碎,成肉糜状。

2. 锡箔纸包裹好,放入少量液氮,快速敲击(控制力量,尽量避免弄破锡箔纸),进一步破碎;反复多次。

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