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PCR反应结束无扩增曲线出现的原因

2022.10.19

扩增效率问题:电泳检测qPCR反应产物,观察是否有目的条带出现。

如果没有,则需要逐一排查引物、模板以及反应条件问题;

确认引物是否降解:长时间未用的引物应先通过 PAGE 电泳检测完整性,以排除引物降解的可能性;

模板浓度太低或目标基因表达丰度过低:减少稀释度,重复实验,一般未知浓度的样品。

通常基因表达检测所需的cDNA量为1-100ng。如样本中目的基因丰度很低,就需要更多的样本量。如果对期望的表达水平不是很确定,可重新查询文献或 NCBI Unigene数据库中EST表达数据来预估在不同组织中的表达水平;

模板降解:重新制备模板,重复实验;逆转录问题:与低表达量相关,如果目的基因在样本中的丰度很低,需要增加实验的灵敏度。确认一下qPCR反应中没有加入过量的cDNA (最大加样水平为 20% v/v),因为过量的cDNA样本会引入抑制剂降低反应效率。

也可以检查一下逆转录酶和引物。随机引物通常比基于oligo(dT) 的方法产生更多的 cDNA。另外,有些逆转录酶经过热稳定性改造,也会提高cDNA产量。


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