哺乳动物细胞真核表达产物接近天然高等生物蛋白质分子
哺乳动物细胞真核表达系统在表达过程中有翻译后修饰和折叠的功能，这一特点使其蛋白更接近天然蛋白，具备天然蛋白必须的空间结构和修饰，与天然蛋白有相同的生物活性，哺乳动物细胞表达系统在功能蛋白、抗体生产、临床疫苗的研发和生产中应用较为广泛。
原核表达系统具有表达水平高、操作简单、周期短、易于大规模高密度培养、成本低等优点，而对于全抗体和糖蛋白类生物药物来说，表达产物多肽链的折叠、二硫键的形成、糖基化的有无以及糖基化的类型常常影响表达产物的合成分泌、生物活性、体内稳定性以及免疫原性等特性。由于原核细胞缺少内质网和高尔基体等可用于进行糖基化的结构和机制，所表达产物是非糖基化的，且常以包涵体的形式存在；
酵母、昆虫及植物等真核细胞虽能进行糖基化，但其糖基化的方式与人类等哺乳动物细胞糖基化的方式是不一样的。与其它真核细胞表达系统相比，目的基因在哺乳动物细胞中表达的蛋白与天然蛋白的结构、糖基化类型和方式几乎相同且能正确组装成多亚基蛋白，并且哺乳动物细胞能以悬浮培养或在无血清的培养基中达到高密度且培养体积能达到1000L以上。
总之，与其他系统相比，哺乳动物细胞表达系统的优势在于能够指导蛋白的正确折叠，提供复杂的N型糖基化和准确的O型糖基化等多种翻译后加工功能，因而表达产物在分子结构、理化性质和生物学功能方面接近于天然的高等生物蛋白质分子。
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