单纯疱疹病毒的进化可追溯至青铜时代
剑桥大学领导的一个研究团队分析了单纯疱疹病毒1（HSV-1）的古老基因组，并首次进行了测序。这种病毒会终生潜藏在宿主体内，引起唇部溃疡，目前全球约有37亿人感染了该病毒。
最新的研究表明，HSV-1病毒谱系大约在5000年前出现。伴随着青铜时代从欧亚草原到欧洲的大规模迁徙以及相关的人口激增，病毒加快了传播。研究人员推测，接吻在病毒传播中也起了作用。这项成果发表在《Science Advances》杂志上。疱疹的历史可以追溯到数百万年前，不同形式的病毒可以感染多个物种，从蝙蝠到珊瑚。尽管HSV-1在现代很流行，但科学家们表示，令人惊讶的是，古代的HSV-1样本却很难找到。
“全世界都目睹了COVID-19病毒在数周和数月内快速变异。然而，对于疱疹这样的病毒，进化时间要长得多，”剑桥大学遗传学系的Charlotte Houldcroft博士说。
“面部疱疹终生隐藏在宿主体内，仅通过口腔接触传播，因此突变在几千年的时间里缓慢形成。我们需要进行深入的调查来了解这样的DNA病毒是如何进化的，”她说。“以往的疱疹遗传数据只能追溯到1925年。”
研究团队成功地在四具距今千年的遗骸中找到了疱疹病毒，并从牙根中提取出病毒DNA。疱疹经常与口腔感染一起爆发：至少两具古老尸体患有牙龈疾病。最古老的样本来自俄罗斯乌拉尔山脉地区出土的一名成年男性，可追溯到大约1500年前的铁器时代晚期。
另外两个样本来自英国剑桥。其中一个是一名来自早期盎格鲁-撒克逊墓地的女性，可以追溯到公元6-7世纪。另一个是14世纪后期的年轻男性，被埋在中世纪剑桥慈善医院的庭院里，患有可怕的牙脓肿。最后一个样本来自荷兰的一名年轻男子。
塔尔图大学基因组学研究所的Meriam Guellil博士表示：“我们大约筛选了3000个考古发现的古代DNA样本，只发现4个带有疱疹病毒。”
基因组和系统发育分析表明，HSV-1谱系可能起源于4,600-6,100年前的欧亚草原，并在大约4,700年前随着青铜时代的迁徙传播到欧洲。研究人员推测，随着新的文化习俗的引入，比如接吻，HSV-1主要毒株出现，并流传至今。
事实上，几个世纪后，罗马皇帝提比略（Tiberius）曾试图禁止在官方场合接吻，以防止疾病传播，这一法令可能与疱疹有关。然而，在人类史的大部分时间里，HSV-1的传播是“垂直”的，也就是从感染的母亲传播给新生儿。
“将古代DNA与20世纪的疱疹样本进行比较后，我们能够分析这些差异，并估计病毒的突变率，从而得出病毒进化的时间表，”伦敦大学学院遗传学研究所的Lucy van Dorp博士谈道。
剑桥大学圣约翰学院研究员、塔尔图大学古DNA实验室负责人Christiana Scheib博士表示：“每个灵长类物种都携带某种形式的疱疹病毒，因此我们认为，自从我们的祖先离开非洲以来，疱疹就一直伴随着我们。”“然而，大约五千年前发生了一件事，让某种疱疹病毒的传播速度超过了其他所有病毒，这可能与接吻有关。”目前已知最早的接吻记录来自南亚的一份青铜时代手稿，表明这种习俗可能是随着从欧亚大陆向欧洲的迁徙而向西传播的。
Houldcroft博士称：“只有数百年甚至数千年的基因样本才能让我们了解DNA病毒，如疱疹病毒和猴痘病毒，以及我们自己的免疫系统是如何相互适应的。”
原文检索
Ancient herpes simplex 1 genomes reveal recent viral structure in Eurasia
SCIENCE ADVANCES
27 Jul 2022
Vol 8, Issue 30
DOI: 10.1126/sciadv.abo4435
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