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打开培养基优化的正确方式

生物技术产业对培养基和工艺优化有着严格的要求。而优化工艺过程以获得尽可能高的产量通常非常耗时。我们应在尽可能减少工作量的同时获取更多信息。高通量、自动化、DoE可以实现这一目的,是未来工艺过程优化的发展趋势。下文展示了通过高通量、自动化、DoE进行培养基优化以提高谷氨酸棒状杆菌蛋白产量的示例。


实验方法

 培养基成分:谷氨酸棒状杆菌初始标准基本培养基,由 42g/L 3-(N-吗啉基)-丙烷磺酸(MOPS)、22g/L 葡萄糖、20g/L硫酸铵、5g/L 尿素、1g/L 磷酸盐缓冲液、13.25mg/L 氯化钙、0.25mg/L 七水硫酸镁、10mg/L 七水硫酸亚铁、10mg/L 一水硫酸锰、1mg/L 七水硫酸锌、0.2mg/L硫酸铜、0.02mg/L六水合氯化镍、0.2mg/L生物素、30mg/L原儿茶酸(PCA)、50mg/L卡那霉素和59.6mg/L异丙基β-d-1-硫代半乳糖苷(IPTG)组成。

 仪器:RoboLector高通量自动化微型生物培养平台

 培养菌株:谷氨酸棒状杆菌(ATCC 13032)pEKEx2-NprE 角质酶菌株

 培养条件:分批培养:温度为 30°C,振摇速度为 1200rpm,初始 OD600 为0.5,每孔初始体积为 800µL。补料分批培养:pH 值调控为7。不同线性补料策略,如f(t) = 5.45 µL/h + 0.1 µL/h ,触发为大于 14h(恰好为分批培养结束)。补料溶液含 440g/L 葡萄糖和 100g/L 尿素。

 培养基制备:通过自动化工作站制备培养基,提高培养基制备通量。由于补料分批培养试验中优化培养基的成分保持不变,所以自动化方法仅用于分批培养试验中的培养基制备。


实验结果

 敏感性分析:敏感性分析可以表征出某些培养基的优化潜力,并确定培养基成分对微生物的生长和蛋白质生产消极或积极的影响。该系列实验被认为是 DoE 中实际优化操作的准备步骤。本案例每种培养基成分的影响是单独考虑的。使用 BioLector观察分批培养过程中的生长行为。通过将10种不同成分分成 38 个不同组进行分析评估,每组 6 个生物学重复。发现对角质酶活性产生最有利影响的培养基成分为:硫酸镁、硫酸亚铁和硫酸锰。


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未添加硫酸锌和硫酸铜的培养基,其余成分浓度翻倍情况下目标值的相对变化分析


使用DoE优化培养基:基于敏感性分析,使用 DoE-Builder 分2个步骤进一步研究硫酸镁、硫酸亚铁和硫酸锰的浓度。首先利用模型进行了15次浓度组合试验,每次 4个生物学重复。以浓度不变的培养基作为对照。基于第 一个优化步骤的结果,计算出24个理论上优化的实验,并使用BioLector在梅花板中进行分批培养。通过2步优化,开发的最 终优化培养基应含有400mg/L硫酸镁、25mg/L硫酸亚铁和20mg/L硫酸锰。


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24个理论上优化实验的光密度和角质酶活性


不同补料速率比较:使用 DoE 成功开发出优化的培养基后,可以在 BioLector中以不同补料速率进行实验,找到提高蛋白产量的理想补料分批培养条件。实验共比较四种不同补料速率,每种8个生物学重复。结果表明补料速率为2g/L∙h + 0.1µL/h产率最 高。


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3g/L·h+0.1μL/h补料分批培养


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不同线性补料速率下的角质酶活性和产率


结论

培养基优化是一个非常复杂的工作,并需要进行大量的实验。BioLector微型生物反应器可一次进行48个样品的平行培养,并可在线监测生物量、pH值、溶氧(DO)和各种荧光分子或蛋白质的荧光强度,同时还能结合微流控芯片技术实现各培养孔独立的 pH 控制和补料分批培养,并可放大工艺。整合自动化工作站的BioLector即RoboLector高通量自动化微型生物培养平台可通过实验设计(DoE)进行培养基制备和执行自动化高通量培养。非常适用于DoE环境下的培养基优化和补料分批培养的研究。


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RoboLector高通量自动化微型生物培养平台


欲了解该应用详情,请扫描下方二维码下载应用指南《利用RoboLector提高谷氨酸棒状杆菌蛋白质产量的培养基优化研究》


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