4D-PRM新品| 吉凯靶向蛋白质组PRM技术全面升级，开启4D-PRM新时代！

上海吉凯基因医学科技股份有限公司

分析测试百科网 > 行业资讯 > 微信文章

4D-PRM新品| 吉凯靶向蛋白质组PRM技术全面升级，开启4D-PRM新时代！

吉凯基因

2022.5.11

Parallel Reaction Monitoring（PRM，平行反应监测技术）是一种针对目标蛋白检测的靶向质谱技术。通过对特异性肽段或目标肽段进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或绝对定量，具有高特异性、高通量、无需抗体等优势。

布鲁克timsTOF Pro与PRM结合，发展出了全新的高通量和高灵敏的靶向蛋白质组学PRM-PASEF技术，由此PRM技术也进入了4D时代。4D-PRM在普通的PRM的基础上，利用离子淌度新一维的分离，提高了离子的选择性和灵敏度，并结合了PASEF的扫描速度优势，从而增加了靶标离子的数量。凭借PASEF技术的速度和额外的TIMS分离优势，4D-PRM在不牺牲检测灵敏度、扫描速度及选择性且单针靶向离子数最大化的前提下，可实现更多更快更准确的靶向蛋白组检测，带领靶向蛋白组学突破研究瓶颈进入新高度！吉凯基因可提供4D-PRM检测服务，如有相关业务需求可咨询当地销售工程师。

传统PRM与4D-PRM数据采集差异

4D-PRM技术优势

4D-PRM核心优势一

更高的离子选择性，定量更准确

在timsTOF Pro上，4D-PRM因为有离子淌度的分离，具有更强的选择性。离子过滤窗口（Ion Mobility Filter）处于关闭状态时，相同质荷比的离子不能有效区分，离子选择性弱。谱图存在明显的杂峰，定量准确性较低；相比之下，离子过滤窗口打开后，离子淌度能有效区分相同质荷比但形状和截面不同的离子，显著降低目标离子的背景，产生更强的离子选择性和更高的定量准确性。

4D-PRM核心优势二

更快的采集速度，相同分析时长下可验证更多目标蛋白

得益于timsTOF Pro大于120Hz的MS/MS扫描速度，PRM-PASEF理论上每100ms的TIMS ramp time可靶向大于12个目标离子，在1s的duty cycle时间内则可靶向超过100个目标离子，使得PRM-PASEF能够在短时间内定量到更多蛋白。因此，在相同分析时长下4D-PRM能以更快的扫描速度实现差异蛋白更高通量的验证。除此之外，4D-PRM快速的扫描能力能采集到更多的数据点，产生专属性更高的MS/MS谱图，极大的提高定量验证的准确性。

4D-PRM核心优势三

更高的检测灵敏度，重复性好，定量偏差小

4D-PRM是扫描速度最快、同步监测离子通道最多的PRM技术，在其高速的采集模式下，依然可以达到非常高的灵敏度。实验结果显示，在30min的液相梯度时间内，可对216个母离子靶向定量，最低定量限达到了17.2 amole，相对标准偏差RSD<20%，具有很好的重复性。

4D-PRM实验流程

4D-PRM实验包含预实验和正式实验两个阶段。预实验为4D-PRM方法的建立与优化阶段。通过分析目标蛋白在4D仪器上的DDA数据特征，针对目标蛋白的特征性肽段，完成RT窗口，m/z，1/k0窗口，电荷，碰撞能等一系列检测参数的设置与优化；预实验完成后则进行正式实验环节，直接对待测样本进行4D-PRM检测，实现对目标蛋白的定量验证。

总结

相比传统PRM，4D-PRM凭借PASEF技术的速度和额外的TIMS分离优势，在不牺牲检测灵敏度、扫描速度及选择性且单针靶向离子数最大化的前提下，可实现更多更快更准确的靶向蛋白组检测！同免疫测定法比较，PRM/4D-PRM一次可检测多种蛋白，无需依赖抗体，其应用前景有望在将来取代传统的WB、ELISA等方法。除了常规蛋白组研究中差异目标蛋白的验证，4D-PRM也为靶向蛋白质组学技术在大队列生物标志物验证和临床转化应用方面带来更多可能。吉凯基因可提供4D-PRM检测服务，如有相关业务需求可咨询当地销售工程师。

吉凯基因凭借多年在靶标筛选及验证服务领域的技术积累，建立的标准化、工程化、系统化的GRP平台，为中国研究型医生提供科研服务，加快科研成果转化。其中，多组学平台包含蛋白质组学平台和高通量测序平台：

·蛋白质组学平台拥有多台timsTOF Pro、Exploris 480高精度质谱仪，专业领先的Spectronaut Plusar、Mascot等分析软件，提供专业的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修饰组、olink蛋白质组等检测服务，强大的机器学习算法、IPA分析、蛋白基因组分析服务，系统的生物标志物、分子分型、药物靶点、基因功能研究等解决方案，真正让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效；

·高通量测序平台分为常规测序服务和单细胞测序服务：单细胞测序拥有10x和BD两个平台，提供单细胞RNA-seq、单细胞核测序、单细胞混样RNA-seq、单细胞TCR/BCR、单细胞（RNA+ATAC）、空间转录组测序等服务；常规测序服务提供meRIP-seq（m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修饰测序）、acRIP-seq（ac4C RNA乙酰化修饰测序）、ATAC-seq、Ribo-seq（翻译组测序）、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全转录组测序（两文库/三文库）、外泌体miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服务。