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合作成果 | MALDI-TOF质谱实现沙门氏菌快速血清型分型

融智生物
2022.8.05

近日,由南昌大学中德联合研究院、江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所与融智生物共同合作的基于MALDI-TOF质谱的沙门氏菌快速血清型分型项目顺利结题。项目旨在建立基于MALDI-TOF质谱的沙门氏菌快速血清型分型检测方法,经过三方的共同努力,项目已经取得一系列成果:

开发了适用于沙门氏菌MALDI-TOF质谱血清分型的沙门氏菌繁殖体质谱上机前处理方案;


开发了适用于沙门氏菌MALDI-TOF MS血清分型的质谱谱图采集条件;


建立了MALDI-TOF质谱采集的常见沙门氏菌不同血清型指纹图谱数据库,可实现对数种常见的沙门氏菌实现快速血清型分型。

沙门氏菌是世界上食源性腹泻最常见的病原菌之一。全球每年估计发生13亿因沙门氏菌导致的急性肠胃炎病例,其中300万患者死亡。2016年起,沙门氏菌引起的食源性疾病病例数超过了诺如病毒,成为了我国食源性疾病的“头号元凶”。

迄今为止世界上已鉴定出2500多个不同的沙门氏菌血清型,沙门氏菌致病性、毒力、传播途径、耐药性在不同型别间有较大差异,因此血清型的正确鉴定对确定人和动物沙门氏菌病的感染源和控制减少发病率具有重要意义。为此,许多国家和地区采取了众多措施以正确鉴定来自不同国家和地区、不同动物和外环境的沙门菌血清型。

本项目建立了一种基于MALDI-TOF MS技术(QuanID微生物质谱系统,融智生物)的“网鱼式”检测方法。该方法操作简单、鉴定速度快、鉴定概率高、结果准确,尤为适合医院、卫生防疫系统。项目通过扩大采集范围,改变培养条件等,比对核糖体蛋白和非核糖体蛋白,寻找出某些血清型区别于其他沙门氏菌的特征蛋白进行建库,用于鉴定部分沙门氏菌血清型,完善沙门氏菌血清型质谱数据库。截止到项目结题,共采集了数百株不同血清型的沙门氏菌,建立了沙门氏菌图谱数据库,并实现了成功鉴别数种常见的沙门氏菌血清型。

图  部分沙门氏菌血清型的谱图

此次项目的顺利结题得益于融智生物QuanID微生物质谱系统(MALDI-TOF MS)的强大功能,专利的技术保证了靶孔间质谱图的重现性(CV<3%)以及仪器检测的高灵敏度、高准确度。尤其是沙门氏菌不同血清型之间的差异更多的是来源于丰度很低的蛋白多肽,只有保证了质谱图的重现性以及对于低丰度蛋白的检测灵敏度才能够实现对于沙门氏菌血清型的准确鉴定。

图  QuanID微生物质谱解决方案

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