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App NGS RNA测序-真核/原核转录组测序服务
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| 参考报价： | 面议 | 型号： | App NGS RNA测序-真核/原核转录组测序服务 |
| 品牌： | 惠研生物 | 产地： | 上海 |
| 关注度： | 暂无 | 信息完整度： |  |
| 样本： | 暂无样本 | 典型用户： | 暂无 |
RNA测序-真核/原核转录组测序服务
采用Hiseq2500高通量测序仪，准确高效产出基因组数据
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA和非编码RNA 。转录组研究是基因功能及结构研究的 基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。
测序技术
真核转录组测序 基于Illumina HiSeq 2500测序平台，研究真核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA。根据研究物种有无参考序列，真核转录组测序可分为有参考基因组测序（Transcriptomere sequencing）和无参考基因组测序（de novo transcriptome assembly）。BioGenius提供2×100bp读长，有参考基因组测序主要有2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型，无参考基因组测序主要有4Gb、8Gb、10Gb三种数据类型的HiSeq 2500真核转录组测序和生物信息分析服务。
原核转录组测序是基于链特异性文库构建技术和Illumina HiSeq 2500测序平台，研究原核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA。根据研究物种有无参考序列，原核转录组测序可分为有参考基因组测序（Transcriptomere sequencing）和无参考基因组测序（de novo transcriptome assembly）。BioGenius提供2×100bp读长，1Gb和2Gb clean data 两种数据类型的HiSeq 2500原核转录组测序和生物信息分析服务。
技术优势
适用于任意物种的全转录组分析：无需了解物种基因或基因组信息，能够直接对任何物种进行最全面的转录组分析
转录组覆盖度高：直接测定几乎所有转录本片段的序列
检测灵敏度高：可以检测基因家族中相似基因及可变剪接造成的单碱基差异
检测范围广：从几个到数十万个拷贝精确计数，可同时鉴定及定量正常和稀有的转录本
为了保证转录组源头数据准确可靠，BioGenius从样品检测到建库都采用最严格的质控标准，且根据客户需求提供两种文库类型:
1.常规转录组文库构建
2.链特异性转录组文库构建
与常规转录组建库方法相比，链特异性转录组分析的内容更多，且在基因组注释、转录本拼接、基因结构和表达分析等方面效果更好
项目流程
服务流程：HiSeq2500模式
基于Illumina HiSeq2500测序平台,2×100bp读长,有参考基因组测序主要提供2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型25天提供全部分析结果，无参考基因组测序主要提供4Gb、8Gb、10Gb clean data三种数据类型的转录组测序和生物信息分析服务，45天获得全部分析结果
服务流程：MiSeq模式
该产品基于Illumina MiSeq测序平台，样品检测合格后有参考基因组的转录组14天内即可获得全部分析结果，无参考基因组的转录组28天内即可获得全部分析结果。目前，BioGenius提供2×250bp读长，2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型的Transcriptome测序分析服务。
采用Hiseq2500高通量测序仪，准确高效产出基因组数据
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA和非编码RNA 。转录组研究是基因功能及结构研究的 基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。
测序技术
真核转录组测序 基于Illumina HiSeq 2500测序平台，研究真核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA。根据研究物种有无参考序列，真核转录组测序可分为有参考基因组测序（Transcriptomere sequencing）和无参考基因组测序（de novo transcriptome assembly）。BioGenius提供2×100bp读长，有参考基因组测序主要有2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型，无参考基因组测序主要有4Gb、8Gb、10Gb三种数据类型的HiSeq 2500真核转录组测序和生物信息分析服务。
原核转录组测序是基于链特异性文库构建技术和Illumina HiSeq 2500测序平台，研究原核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的所有mRNA。根据研究物种有无参考序列，原核转录组测序可分为有参考基因组测序（Transcriptomere sequencing）和无参考基因组测序（de novo transcriptome assembly）。BioGenius提供2×100bp读长，1Gb和2Gb clean data 两种数据类型的HiSeq 2500原核转录组测序和生物信息分析服务。
技术优势
适用于任意物种的全转录组分析：无需了解物种基因或基因组信息，能够直接对任何物种进行最全面的转录组分析
转录组覆盖度高：直接测定几乎所有转录本片段的序列
检测灵敏度高：可以检测基因家族中相似基因及可变剪接造成的单碱基差异
检测范围广：从几个到数十万个拷贝精确计数，可同时鉴定及定量正常和稀有的转录本
为了保证转录组源头数据准确可靠，BioGenius从样品检测到建库都采用最严格的质控标准，且根据客户需求提供两种文库类型:
1.常规转录组文库构建
2.链特异性转录组文库构建
与常规转录组建库方法相比，链特异性转录组分析的内容更多，且在基因组注释、转录本拼接、基因结构和表达分析等方面效果更好
链特异性转录组文库构建原理图
项目流程
服务流程：HiSeq2500模式
基于Illumina HiSeq2500测序平台,2×100bp读长,有参考基因组测序主要提供2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型25天提供全部分析结果，无参考基因组测序主要提供4Gb、8Gb、10Gb clean data三种数据类型的转录组测序和生物信息分析服务，45天获得全部分析结果
服务流程：MiSeq模式
该产品基于Illumina MiSeq测序平台，样品检测合格后有参考基因组的转录组14天内即可获得全部分析结果，无参考基因组的转录组28天内即可获得全部分析结果。目前，BioGenius提供2×250bp读长，2Gb、4Gb、8Gb clean data三种数据类型的Transcriptome测序分析服务。
转录组测序建库测序流程
技术参数
真核生物转录组要求
一、样品要求
常规转录组测序
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（单次）：植物和真菌样品：≥20 μg；人、大鼠、小鼠样品：≥5 μg；其他类型动物：≥10 μg；
样品浓度：植物和真菌样品：≥250 ng/μL；人、大鼠、小鼠样品：≥65 ng/μL；其它类型动物样品：≥150 ng/μL；
样品纯度：真核：OD260/280 =1.8～2.2；OD260/230 ≥2.0；动物样品：RIN ≥ 7.0，植物样品：RIN ≥6.5，28S:18S ≥1.0；昆虫样本无此指标；
TruSeq微量转录组
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（一次建库量）：人、大鼠、小鼠样品：≥200ng；其他物种：≥1μg。
样品浓度：人、大鼠、小鼠样品：≥5ng/μL；其他物种：≥20ng/μL。
样品纯度：动物样品（昆虫除外）：RIN≥7.0；28s/18s≥1.0；植物、真菌：RIN≥6.5；28s/18s≥1.0。
二、项目运转周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。
三、项目合格指标
产生不低于合同规定的clean reads数。
原核微生物转录组要求
一、样品要求
常规转录组测序
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（单次）：原核生物样品：≥5μg。
样品浓度：原核生物样品：≥65 ng/μL。
样品纯度：原核生物样品：OD260/280≥1.8；OD260/230 ≥1.8；RIN ≥6.0，23S:16S≥1.0。
TruSeq微量转录组
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（一次建库量）：≥1μg。
样品浓度：≥20ng/μL。
二、项目运转周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。
三、项目合格指标
产生不低于合同规定的clean reads数。
真核生物转录组要求
一、样品要求
常规转录组测序
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（单次）：植物和真菌样品：≥20 μg；人、大鼠、小鼠样品：≥5 μg；其他类型动物：≥10 μg；
样品浓度：植物和真菌样品：≥250 ng/μL；人、大鼠、小鼠样品：≥65 ng/μL；其它类型动物样品：≥150 ng/μL；
样品纯度：真核：OD260/280 =1.8～2.2；OD260/230 ≥2.0；动物样品：RIN ≥ 7.0，植物样品：RIN ≥6.5，28S:18S ≥1.0；昆虫样本无此指标；
TruSeq微量转录组
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（一次建库量）：人、大鼠、小鼠样品：≥200ng；其他物种：≥1μg。
样品浓度：人、大鼠、小鼠样品：≥5ng/μL；其他物种：≥20ng/μL。
样品纯度：动物样品（昆虫除外）：RIN≥7.0；28s/18s≥1.0；植物、真菌：RIN≥6.5；28s/18s≥1.0。
二、项目运转周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。
三、项目合格指标
产生不低于合同规定的clean reads数。
原核微生物转录组要求
一、样品要求
常规转录组测序
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（单次）：原核生物样品：≥5μg。
样品浓度：原核生物样品：≥65 ng/μL。
样品纯度：原核生物样品：OD260/280≥1.8；OD260/230 ≥1.8；RIN ≥6.0，23S:16S≥1.0。
TruSeq微量转录组
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。
样品需求量（一次建库量）：≥1μg。
样品浓度：≥20ng/μL。
二、项目运转周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。
三、项目合格指标
产生不低于合同规定的clean reads数。
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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途
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