DSAM-09 甲基化与组蛋白修饰关联分析


本方案目的是比较不同细胞发育时期或组别状态之间不同CpG富集区内甲基化水平(%)，同时将染色质修饰状态因素与甲基化水平进行关联，或与细胞发育时期、细胞状态的关联。

案例分析：例如参看下图：ES和NPC对比H3K4me3,H3K4me2,H3K4me1,H3K27me3状态对比。对于神经分化因子基因loci,非甲基化的CpG富集启动子区是在ES细胞中显示bivalent特性，且非激活状态；在NPC中，将恢复到单一状态(univalent)的H3K4me3，基因因此得到激活。H3K4me2富集出现在距离分化因子基因Olig2，Olig1loci较远的HCNE区域上，并且显示与CpG去甲基化相关。红色，黄色和绿色分别表示甲基化的高，中，低水平；

 

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