Affymetrix全基因组SNP芯片检测简介 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 指基因组单个核苷酸的变异，它是最微小的变异单元，是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。
Affymetrix全基因组SNP芯片检测
简介
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 指基因组单个核苷酸的变异，它是最微小的变异单元，是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。单核苷酸多态性是基因组上高密度的遗传标志，在人类基因组中已发现的SNP数量超过3000万。作为第三代遗传标记，SNP数量众多、分布密集、易于检测，因而是理想的基因分型目标。SNP分型检测在疾病基因组（如疾病易感性），药物基因组（药效、药物代谢差异和不良反应）和群体进化等研究中具有重大意义。 在人研究方面，Affymetrix 公司有分别基于GeneChip和GeneTitan平台的 SNP 6.0 芯片和针对中国人群设计的CHB1＆2 Array，既可用于全基因组SNP分析，又可用于CNV分析，极大地方便了中国人类疾病GWAS研究。Affymetrix公司针对多个农业物种也开发了多款商品化的基因分型芯片，如鸡、牛、水牛、鲑鱼、水稻、小麦、辣椒、草莓等，为农业育种研究、遗传图谱构建、群体基因组学研究提供研究手段。此外，Affymetrix公司还支持定制芯片，最低起订量为480个样品。
检测原理
基于GeneChip平台的人SNP 6.0 芯片实验流程：
基于GeneTitan平台的Axiom基因分型芯片检测流程：
技术优势
SNP和CNV兼容检测：同一种芯片即可用于SNP检测，又能用于CNV分析；
高覆盖率：具有极高的全基因组探针物理覆盖率，检测的遗传标记间中位距离为680 bp；
高重复性：独特的芯片设计保证了高重复性和检测一致性；
完善的实验室条件：博奥生物专业的分型实验室条件，合理布局和气压控制，防止PCR产物污染；
严格的服务管理：博奥生物分型实验室具有多套仪器设备备份，操作熟练而稳定的技术员团队，运行严格的管理体系；
丰富的服务经验：博奥生物具有丰富的技术服务项目经验。
产品列表
| 物种 | 产品编号 | 产品名称和适用平台 | 数据库来源 | 检测位点数量 |
| 人 | AFF-901764 | AxiomTM Genome-Wide CHB1 Array Plate (GeneTitan平台) | 来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库 | 640,673 |
| AxiomTM Genome-Wide CHB1&2 Array Plate (2张芯片/set，GeneTitan平台) | 来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库 | 1,296,521 | ||
| AFF-901640 | AxiomTM Genome-Wide ASI 1 Array Plate (GeneTitan平台) | 来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库 | 600,307 | |
| AFF-901153 | Genome-Wide Human SNP array 6.0 (GeneChip平台) | SNPs： 482,000个SNPs源于品500K和SNP5.0芯片； 424,000个SNP源于HapMap计划中的tag SNPs，X，Y染色体和线粒体上具代表性的SNPs；dbSNP数据库；重组热点区域；CNVs：源于多伦多基因组变异体数据库的5,677个已知拷贝数变异区域，202,000探针。平均分配到整个基因组上，用来发现求知的拷贝数变异区域的744,000个探针。 | 906,000 SNPs+946,000 CNVs | |
| 牛 | AFF-901791 | AxiomTM Genome-Wide BOS1 Array Plate (GeneTitan平台) | 来源于Affymetrix Bovine Consortium，对20多种品系收集的超过3百万个经实验确认的SNPs位点 | 648,855 |
| 水稻 | Rice 44K SNP Genotyping Array (GeneChip平台) | 与Cornell University的Dr. Susan R.McCouch合作开发 | 44,100 |
Affymetrix全基因组SNP芯片检测价格
Affymetrix全基因组SNP芯片检测信息由北京博奥晶典生物技术有限公司为您提供，如您想了解更多关于Affymetrix全基因组SNP芯片检测报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。
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