染色质免疫共沉淀(Ch-IP)
一、技术原理
在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理将染色质切为
小片段后,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,
以富集存在组蛋白修饰或者转录调控的DNA片段,再通过多种下游检测技术(定量PCR、
基因芯片、测序等)来检测此富集片段的DNA序列。
二、实验步骤
1.样品准备与交联
细胞收集后,用37%的formaldehyde处理细胞,交联核酸与DNA结合蛋白;加入甘氨
酸终止。
2.细胞超声波破碎染色质
用超声方法随机把染色质破碎成200-1000bp的DNA片段;片段分成两部分,一份用于
免疫共沉淀,一份用于对照实验(InputDNA)。
3.免疫沉淀反应
使用目的蛋白质的特异性抗体与超声破碎的DNA片段进行免疫沉淀,形成DNA-蛋白
质-抗体复合物,利用proteinA/G琼脂糖磁珠富集抗体复合物。通过抗原和抗体反应形成
DNA-蛋白质-抗体复合体,然后沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段
4.DNA-蛋白质-抗体复合物的解交联和DNA纯化
将富集的DNA-蛋白质-抗体复合体解交联释放DNA片段,并进行纯化;InputDNA的
片断作不进行IP实验,但需要去交联并纯化
5.PCR鉴定
比较ChIPDNA,InputDNA及对照DNA信号强度,进行普通PCR或者相对精确的荧光定
量PCR扩增。
三、服务流程
1.甲醛处理细胞
2.超声破碎染色质
3.加入proteinA,沉淀抗体-靶蛋白-DNA复合物
4.解交联
5.PCR分析
四、服务说明
1.客户提供
新鲜的样品材料(组织或细胞);ChIP级别的抗体(或由我公司代购);如ChIP结束
后进行检测,input作为对照;如结束后进行普通PCR或者荧光定量PCR,则需要提供预测
靶基因结合位点的具体序列或目标靶基因的名称、种属、序列或GeneBankAcession)
2.公司提供
1)检测图;
2)完整的实验报告,包括对每个步骤的详细说明(具体操作方法、试剂或溶液浓度等),
以及相应的结果及分析。
3.实验周期
3-4周。
4.价格
9000元/次(含试剂盒)抗体由客户提供
五、质量承诺
提供清晰的图片、可靠的数据和分析结果。
染色质免疫共沉淀价格
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