Pyrosequencing甲基化检测服务

焦磷酸测序技术（Pyrosequencing）作为一种新的序列分析技术，能够快速地检测甲基化的频率，对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测，为甲基化研究提供了新的途径。上海伯豪为您提供基于QIAGEN公司焦磷酸测序平台的服务。

一、焦磷酸测序技术原理

焦磷酸测序技术是由4种酶（DNA 聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶）催化的同一反应体系中的酶级联化学发光反应。具体过程如下：

1.仪器向待检测样品中每次只加入一个核苷酸碱基(dNTP)
2.互补的碱基结合在模板上时，会释放出焦磷酸基团Pyrophosphate (PPi)
3.PPi在ATP硫酸化酶(ATP Sulfurylase)作用下，合成ATP，ATP作为能量分子，驱动荧光素在荧光素酶(Luciferase)的催化下转化为氧化荧光素，并发出与ATP能量成正比的荧光信号
4.信号被CCD数码相机捕捉，形成峰形PyrogramTM
5.未与模板结合的碱基将被三磷酸腺苷双磷酸酶(Apyrase)降解
6.加入下一种dNTP

二、焦磷酸测序实验流程

三、焦磷酸测序在DNA甲基化中的应用

1.基因组整体水平的甲基化检测
2.特异位点的甲基化检测
3.寻找新的甲基化位点

四、焦磷酸测序结果展示

五、 案例分析


焦磷酸测序检测宫颈癌中UTF1启动子区域甲基化水平

研究者利用Illumina HumanMethylation27芯片对9例样本（4例正常，5例宫颈癌）进行全基因组启动子区甲基化扫描，结果显示宫颈癌患者UTF1启动子区域呈现出高的甲基化状态。为了验证芯片筛选的结果，采用焦磷酸测序方法首先对这些样本的UTF1启动子区域进行深入分析，结果表明正常宫颈中UTF1启动子区域呈现低甲基化状态，而相同的位点在SCC中呈现高甲基化状态。为了进一步验证，研究者扩大样本量，对47例不同类型的石蜡包埋组织样本及10例白细胞进行焦磷酸测序检测，与之前的结论保持一致。结合RNA水平和蛋白水平的实验，研究者最后提出UTF1启动子甲基化状态可以作为宫颈癌诊断的一个重要的分子标志物。


原文：Aberrant Promoter Methylation and Expression of UTF1 during Cervical Carcinogenesi. Plos One. 2012 ,7(8):e42704.

Pyrosequencing甲基化检测服务价格

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