微生物多样性测序基于第二代高通量技术对16SrRNA/18SrRNA/ITS等基因序列进行测序,能同时对样品中的优势物种、稀有物种以及一些未知的物种进行检测,获得样品中的微生物群落组成以及它们之间的相对丰度。探讨微生物多样性对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用有着重要的理论和现实意义。 ...
2.2.3.1 宏基因组测序(mNGS)简介mNGS(metagenomics next-generation sequencing),也称宏基因组二代测序技术,是一种不基于培养, 借助二代测序平台快速测序直接从环境/临床样品中提取全部微生物的核酸序列,进一步与各个物种的基因组序列对比,从而得知样品中微生物的种类和比例的高通量测序方法,可广泛分析临床样本微生物组(细菌、真菌、病毒)。...
为评估BGISEQ-500的宏基因组测序应用性能,该研究团队收集并提取了20例健康成年人粪便DNA,采用BGISEQ-500的SE100测序策略完成该20例样本的深度宏基因组测序。...
土壤中细菌的多样性差距非常大,因土壤结构的不同土壤中的细菌群体也呈现出多样化。Triplett等[10]基于焦磷酸测序法来对16S rRNA的V2-V3区域进行测序,估测9个草地土壤中的菌群的整体和垂直特性。对所有752,838条数据序列进行聚类分析,探索菌群在丰度、多样性和组成成分等方面的特异性。...
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