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准确可靠的蛋白含量测定技术是蛋白质科学的重要基础。定量蛋白组学研究的主要技术策略有基于二维凝胶电泳的方法,稳定同位素标记结合质谱定量的方法以及非标记定量的方法等。该技术降低了分析复杂度,但同时可能会丢失部分信息,那么,液相色谱串联质谱法应该作为蛋白质定量的参考测量程序吗?首先必须厘清关于参考测量程序的概念:什么是参考测量程序?...
当然,有一些新的技术方法,需要的细胞量会非常少,比如,现阶段我们常提到的微量样本蛋白质组学,能对10-1000个细胞进行蛋白质组学实验;随着蛋白质组学技术的发展,甚至能对一个细胞进行蛋白质组学分析,比如单细胞蛋白质组学等。PART02动物组织在这里我们提到的处理方法只适合比较常规的动物组织样本,包括心、肝、脾、肺、肾、肌、脑等组织;皮肤、毛发、骨组织等不在此列,需要利用特殊的处理方式。...
作者团队开发了优化LC-MS/MS参数的模块化和交互式工具DO-MS。DO-MS通过对肽段分离和扫描,到谱图匹配等各个阶段的数据进行交互式可视化来诊断分析中的问题,是SCoPE2的一个主要组成部分。其一大优势在于可以显示肽段洗脱时距离峰值的时间偏移以及肽段进入二级质谱分析的时间。...
主要的原因有:①肽段在质谱上的灵敏度远远高于蛋白质;②大多数MS 分析器的m/z 检测上限比较低(<1 500),无法分析相对较大的蛋白质的多电荷母离子,而大多数肽段的m/z 可以很容易地被几乎所有MS 分析器检测到;③在体内环境中,蛋白质通常会携带翻译后的修饰,这会改变蛋白质的质量并引入相当大的分析变异性,而当在肽段水平上定量蛋白质时,选定的肽段通常不会发生变化,从而确保检测分析的可靠度和重现性。...
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