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在肿瘤panel测序中,主要检测SNV和Indel两种突变类型,参数调整后可分析CNV。部分panel的设计还可以鉴定染色体易位。对于肿瘤panel基因测序数据,鉴定后的变异位点都需要进行该位点可视化查看和确认,如The IntegrativeGenomics Viewer (IGV)。(4)变异注释:基于通用数据库,对突变基因位点进行功能注释,详见下文。 ...
源数据模块提供统计数据常用的统计功能,使用结构化查询语言(SQL)对统计需求实时查询,一个需求关联一条 SQL 语句,便于添加和修改统计需求。常用功能包括最大值、最小值、平均值、中值等的计算。例如,检出频次最多的 N 种农药的查询;检出农药平均频次数最多的 N 种蔬菜;中国标准下超标倍数最大的 N 种农药等的统计。...
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