进一步的进化分析发现竹叶花椒大约在26.6个百万年前发生了一次全基因组加倍事件,随后伴随着全长逆转录转座子(LTR)的大量扩张,这也导致了竹叶花椒基因组大小增加到甜橙的8.5倍。有趣的是,LTR的插入也导致一些与缺水响应相关的基因表达量上调,可能与花椒属植物抗旱性的增强有关。 ...
此外,花椒异常复杂的基因组、退化的繁殖策略和独特的适应性表型也赋予了其在植物适应性演化研究中的独特价值。 基于高深度测序、Canu组装和“边聚类边去冗余”的策略,研究团队组装了目前连续性和完整度最优的竹叶花椒和红花椒基因组。...
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