鼻息肉病与正常鼻黏膜组织的蛋白质组差异分析

[摘要] 　目的:建立分辨率高和重复性好的鼻息肉病及对照鼻黏膜双向凝胶电泳(22DE) 图谱,筛选鉴定差异表达蛋白质。方法:收集鼻息肉病(鼻息肉病组) 及对照鼻黏膜标本(对照组) 各7 例,固相p H 梯度22DE、凝胶银染,扫描图像, Image Master 22DE Elite 4. 01 软件分析,识别差异表达蛋白质,质谱仪得到相应肽质指纹图谱(PMF) ,Pept Ident 软件查询Swiss2Prot and TreMBL 数据库,鉴定差异表达蛋白质。结果: ①鼻息肉病组和对照
组各自随机挑选的1 个样本3 次重复22DE ,平均蛋白质点数分别为891 ±67 和936 ±62 ;匹配点数为767 ±83 和821 ±78 ,平均匹配百分率为86. 1 %和87. 7 %;同一鼻息肉病的3 块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性,不同胶间蛋白质点在等电聚焦电泳( IEF) 方向偏差为(1. 13 ±0. 16) mm ,在SDS2聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS2PA GE) 方向偏差为(1. 45 ±0. 21) mm。分析2 种组织各7 例样本的22DE 图谱的平均凝胶图谱,鼻息肉病组和对照组蛋白质点数为1 532 和1 617 ,匹配点数为1 065个。②质谱分析差异蛋白质点20 个,获取16 张PMF ,查询数据库鉴定出差异蛋白质11 个。结论:本研究建立了分辨率高和重复性好的鼻息肉病及鼻黏膜的22DE 图谱,识别鉴定出一些与鼻息肉病变相关的差异表达蛋白质。