小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳2飞行时间质谱研究

摘要:目的　应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌( SCLC) 与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC 发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法　应用双相电泳(22DE) 分离6 例SCLC 及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI2TOF2MS) 获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱( PMF) ;通过Mascot 软件查询NCBI 或SWISS2PROT 数据库鉴定蛋白质。结果　每张图谱约检测到800 多个蛋白质点。经匹配分析,肺癌组织之间和正常肺组织之间凝胶图像的匹配率分别为75. 5 %和78. 2 %;选择14 个背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析,结合表观分子量及等电点(p I) ,初步鉴定了11 种(六类) 蛋白质: ①与蛋白质降解通路有关的蛋白质:蛋白酶体α亚单位3 型、蛋白酶体β亚单位2 型及β亚单位5 型; ②自由基/ 抗氧化剂类:锰2超氧化物歧化酶(Mn2SOD) 、过氧化氢酶(CAT) 和黄素还原酶( FR) ; ③细胞骨架类:原肌球蛋白23 ( Tpm23) ; ④与能量代谢有关的蛋白质:硫氧还蛋白过氧化物酶( TPX1) ; ⑤分子伴侣:抑制素( PHB) ,内质网蛋白ER29 ( Erp29) ; ⑥其他:可溶性NSF 黏附蛋白(alpha SNAP) 。结论　应用22DE 及MALDI2TOF2MS 方法分离并初步鉴定了11 种(六类) 蛋白质;这些蛋白质与SCLC 发生发展密切相关,部分可能成为SCLC 诊断及治疗的分子靶点。