一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法
上一篇 /
下一篇 2009-01-09 19:02:04/ 个人分类:蛋白质
- 文件版本: V1.0
- 开发商: 本站原创
- 文件来源: 本地
- 界面语言: 简体中文
- 授权方式: 免费
- 运行平台: Win9X/Win2000/WinXP
摘要:
分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的一种重要方法,为此建立了基于诱导
契合的分子对接
优化模型. 模型中引入
残基基团的概念,将
蛋白质划分成若干个残基基团,通过这些残基基团的运动近似表征整个蛋白质的运动情况,并将配体小分子的运动处理为平移、转动和柔性键旋转三部分分量. 设计了一个将k2均值聚类和遗传算法相结合的快速迭代格式,并采用多种群遗传策略和信息熵控制的空间减缩搜索
技术加速了分子对接设计中的遗传演化进程. 在此基础上,开发了一种考虑
蛋白质柔性的对接程序FlexGAsDock. 数值
试验表明,该程序较好地平衡了效率与精度之间的关系,取得了满意的对接结果.
下载提示:
1.您还没有登录,只有登录后才可以下载此资源,
,
2.如果您还没有注册,请
3.下载不减少用户积分。
收藏
分享给好友
推荐到圈子
管理
举报
TAG: 分子对接蛋白质柔性残基基团优化模型