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GBS(Genotyping-by-Sequencing)是指通过测序进行基因分型,其命名是为了与传统的通过芯片进行基因分型的方法相区别。原理是将基因组DNA进行酶切,然后对酶切片段两端序列进行高通量测序,通过分析获得SNP信息并进行基因分型,是一种快速、简便、低成本的基因分型方法,适合对大规模样品进行标记筛选。
技术优势
研究内容
标准信息分析
1. 测序数据基本分析
2. tag产出数据统计
3. 个体tag聚类
4. 群体tag聚类
5. SNP 检测
高级信息分析——遗传图谱
1. 基因分型
2. 遗传图谱构建
3. QTL定位(需提供表型数据)
4. 遗传图谱整合(需提供同一作图群体原图谱数据)
高级信息分析——群体进化
1. 群体进化树分析(Phylogeny tree)
2. 群体结构分析(Structure)
3. 群体主要成分分析(PCA)
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