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首都医大：miRNA调控大型哺乳动物牙齿发育
MicroRNA(miRNA)在啮齿类动物牙齿发育过程中扮演着重要的调控角色，但我们对其在大型哺乳类动物的牙齿发育中的作用知之甚少。现在，首都医科大学副校长王松灵教授领衔的团队利用Seq-Array™(芯片与二代测序相结合策略)技术方法鉴定出小型猪在下乳牙发育过程中的特定miRNA组和表达谱(由联川生物完成Seq-Array™技术服务)，此项研究也为探索小型猪牙齿发育的分子机制提供了重要信息*。该研究成果发表在2012年12月刊PLoS ONE上。
王松灵教授团队首先使用二代深度测序技术大规模筛查小型猪(Sus scrofa)在下乳牙发育过程中的miRNA表达谱，鉴别出637条miRNA序列。深度测序获取的结果,可以广泛地覆盖不同发育时期和不同来源样品中的全部miRNA，而不需要任何已知的序列信息。然而，由于样品处理相对的高成本与低通量特性，如果用测序进行重复性的验证和(或是)表达谱分析将会发现花费很长时间，而且价格昂贵。
代替重复测序，使用芯片可以进行高通量的表达谱分析。芯片上可以涵盖完整的测序发现的序列信息，系统的分析表达谱，并进行差异表达分析。芯片具有快速、可重复，并且性价比高的特点。
研究人员将测序发现的候选miRNA，和105条已知的Sus scrofamiRNA定制合成在miRNA芯片上用于分析牙齿发育的四个时期：牙芽期，帽形期，钟形早期，钟形晚期的miRNA表达谱。芯片分析结果显示在四个发育时期有166个miRNA存在差异表达。生物信息学分析鉴别出18个关键miRNA，包括 let-7f，miR-128, miR-200b, 和miR-200c，在牙齿发育过程中也许扮演着关键角色。
*Li A, Song T, Wang F, Liu D, Fan Z, Zhang C, He J, Wang S. (2012) MicroRNAome and Expression Profile of Developing Tooth Germ in Miniature Pigs. PLoS One 7(12):e52256.
