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成都生物所发现一种单核苷酸多态性新型检测方法

2013.7.08

  单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上,由于单个核苷酸的转换、颠换、插入或缺失等引起DNA序列的多态性,它与许多疾病直接相关。因此,快速、准确、廉价的SNP检测技术的开发,对药物研究、个体化医疗、临床试验和分子诊断等至关重要,而目前大多数的SNP检测方法均需要复杂的探针标记,并依靠高成本的检测设备。中国科学院成都生物研究所唐卓研究员课题组,以有机化学、核酸化学及化学生物学为研究方向,一直致力于基于核酶开发核酸检测生物传感器的研究,最近报道了一种新型的基于DNAzyme和Gap-LCR的SNP检测技术。

  唐卓课题组向Gap-LCR探针中引入了一条短的功能DNA序列(DNAzyme),进而避免了对探针的化学修饰;然后利用两种核酸外切酶依次降解体系中没有发生连接反应的磷酸化探针和释放Gap-LCR扩增产物中的DNAzyme序列;最后利用DNAzyme与卟啉铁(hemin)或者卟啉铁类似物的结合物具有类似于过氧化物酶活性的性质,催化H202氧化底物(ABTS,盐酸酪胺等)成有色或者能产生荧光信号的物质,直接在室温下通过颜色或者荧光信号变化来进行检测。最终,研究人员获得了一种具有高灵敏度和专一性的SNP检测技术,检测限达到1000分子,同时能够从100000个干扰分子中检测到一个目标分子。

  此研究验证了方法的灵敏度、专一性以及通用性。研究人员成功地将检测技术应用到血液DNA样本中新生儿耳聋基因最常见的突变位点GJB2 235delC位点的检测。

  相关研究结果发表在期刊Biosensors and Bioelectronics.

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