很多情况下某些蛋白质的绝对量并不会发生明显变化,而是通过各种翻译后修饰来完成或改变其功能。在数量众多的蛋白质翻译后修饰中, 磷酸化修饰是非常重要的一种, 现今发现的所有蛋白质中超过30%可被磷酸化修饰。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号转导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多肽的定量分析可帮助我们阐明上述过程的机理,进一步认识生命活动的本质。蛋白质磷酸化是一种细胞内传递信号的有效机制。细胞接收胞外信号，通过细胞内激酶以及磷酸酯酶的作用，对蛋白质进行快速磷酸化/去磷酸化修饰，影响蛋白质功能，使得细胞对外界刺激做出迅速而精确的反应。分析细胞/组织中蛋白质的磷酸化状态，对信号通路的研究具有非同寻常的意义。