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  • 荧光定量PCR仪技术及其在医学中的应用

    UUBird 发布于 2009-04-27 10:18:43

      1 概述

      荧光定量多聚酶链式反应是一种新的核酸定量技术。该技术将荧光能量传递技术(fluorescence resonance energy transfer,FRET)应用于常规多聚酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)仪中,从而进行定量检测。FRET即是通过受体发色团之间偶极一偶极相互作用,能量从供体发色团转移至受体发色团,转移效率与曲个发色团之间距离的6次幂倒数成比例。与普通定量PCR相比,荧光定量PCR仪具有可实时监测、准确性高、效率高等优点,本文综述目前国内外几种荧光定量PCR仪技术及应用。

      2 荧光定量PCR 方法

      2.1 TagMan

      TagMan技术是利用Tag酶5 外切酶活性,即Tag酶具有天然的5 、一3 核酸外切酶活性,能够裂解双链DNA5 端核苷酸,释放出单个或寡核苷酸,裂解的最佳底物是被置换了的具有又样结构的单链DNA,水解作用发生于结合了置换部位的磷酸二酯键处。基于Tag酶的这种活性,设汁合成一个能与PCR产物杂交的探针,该探针的5 端标记一个荧光分子.3 端标记另一个荧光分子。其中3 端荧光分子能够吸收5 端荧光分子发出的荧光,因此,正常情况下该探针检测不到3 端荧光分子的荧光信号,但当溶液中有PCR 产物(模板)时,该针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而激活Tag酶5 外切酶活性,将探针5 端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏了两荧光分子间的FRET,从而发出荧光,切割的荧光分子数与PCR产物的数量成正比。因此,根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的量。其主要不足是:

      2.2 Molecular beacon

      分子信标技术(molecular beacon)也是在同一探针的两末端分别标记荧光分子和淬灭分子,与Tag Man探针不同的是,该探针5 和3 末端自向形成8个碱基左右的发卡结构,此时荧光分子和淬灭分子邻近,因此不会产生荧光。当溶液中有特异模板时,该探针与模板杂交,从而破坏了探针的发卡结构,于是溶液便产生了荧光。荧光的强度与溶液中模板的量成正比。因此可用于PCR定量分析。该方法的特点是采用非荧光染料作为淬灭分子,荧光本底低 其不足之处是:(1)杂交时探针不能完全与模板结合,稳定性差;(2)探针合成时标记较复杂

      近来,基于Molecular beacon的原理,人们对其进行改进,使用了一种发卡式引物(sunrise primer).此法能将所有扩增产物均标记上荧光分子,因此荧光信号响应快。但无法区分特异和非特异扩增是致命不足 为了克服不足,人们义对其进行改进,发明了一种称为蝎状引物(scorpion primer)的荧光定馈PCR技术。该技术在引物与Molecular beacon探针之间连接一个间隔臂,使PCR延伸反应时不能够延伸至Molecular beacon分了 这样,非特异扩增产物便无荧光信号,但当有物异扩增产物时, 即可与Molecular beacon进行分了内杂交, 产生荧光信号既解决了非特异问题,又保留了响应快的特点。但仍存在杂交时, 探针不能完全与模板匹配及合成复杂的问题.

      2.3 Amplisensor

      Amplisensor是一种复合探针技术,一个探针上连接一种荧光物,另一探针连接一种淬灭物。 探针长度不同,其中淬灭物标记探针5 端多出7个碱基(GCGTCCC)。PCR扩增前需将荧光物标记探针与一个半套式PCR引物连接,PCR引物的5 应有一段与长探针互补的序列. 以便连接酶将该引物与短探针连接。扩增时该探针一引物复合物作为半套式引物掺入模板,从而释放淬灭探针部分,破坏了荧光能量传递,产生荧光。荧光的强度与扩增时加入的模板数成正比。该方法主要特点:(1)采用半套式PCR扩增,提高了灵敏度,但无法区分引物二聚体形成产生的非特异扩增信号,使定量准确度受到影响;(2)每次PCR扩增前,要先进行Amplisensor的标记,增加了操作步骤和检测成本;(3)中间需加入半套式引物,增加了污染机会。

      2.4 Lightcycler

      Lightcycler是新近发展起来的一种定量PCR技术,该技术将荧光分子和淬灭分子分别标记在两个不同的探针上,形成发光探针和淬灭探针,发光探针的5 端与淬灭探针的3 端分别连接荧光分子。两探针设计为可与模板同一条链相邻的序列杂交,杂交时两探针的荧光分子和淬灭分子紧密相邻,从而发生FRET使荧光淬灭的程度与起始模板的量成反比,以此进行定量分析。该方法淬灭效率高,但由于两个探针结合于模板上,因此影响扩增效率。此外,由于需合成两个较长探针,合成成本较高。

      3 在医学中的应用

      3.1 病原体测定

      PCR技术的问世使病原体检测能够快速、方便地进行。由于PCR技术假阳性率太高,只要有微量病原体存在就可得到阳性结果,这并不能作为诊断依据, 只有当一定数量的病原体存在时才有临床意义。因此,对模板准确定量显得特别重要,应用荧光技术PCR(FQ—PCR)就能够快速、准确地得到结果。对于解决免疫学检测的“窗口期”问题,判断疾病是否处于隐性或亚临床状态,以及抗体检测不能判定是现症感染还是既往感染时,均可利用FQ—PCR进行确定。

      一些研究资料表明,病原体感染后的发病时间,病情轻重及预后往往与病原体数量相关。如HIV感染后,潜伏期长短、临床症状轻重与血液中病毒量显著相关,甚至可根据HIV的量比较准确地预测发病时I 。在研究其他病毒感染性疾病是否有类似情况,病原体的致畸和致突变作用是否与病原体的量等有关问题时,也可利用FQ—PCR来阐明。另据研究发现,病毒的数量与某些药物的疗效相关。例如,干扰素对肝炎病毒高拷贝者不敏感,对低拷贝者敏感。因此利用FQ—PCR对某些病毒的定量分析可指导临床用药和制定治疗方案。

      3.2 肿瘤研究

      尽管肿瘤发病的分子机制尚未完全阐明,但相关基因的遗传学改变的积累是致癌性转变的根本原因已得到普遍承认。癌基因的表达增加和突变在许多肿瘤早期和良性阶段就可出现,FQ—PCR 不但能有效地检测基因的突变,而且能准确测定表达量,据此进行肿瘤早期诊断、分型、分期和预后判断。某些癌基因的遗传学变化的检测几乎达到确诊肿瘤的程度。例如,CD 基因的异常拼接表达,几乎只有出现于某些泌系肿瘤。对于有慢性骨髓性白血病都可检测到原癌基因易位导致的BCR/ABL融合基因形成,FQ—PCR技术不但可通过检测BCR/ABL融合基因的表达而进行肿瘤诊断,还可检测治疗中和治疗后微量残余恶性细胞存在的数量,以此作为治疗效果和估计复发的危险性的依据。

      3.3 其他方面

      在基因表达研究中, 由于FQ—CPR的应用,对mRNA的检测显得较以前常用的方法, 如Northem印迹、RT—PCR定量法要方便、快速、准确得多。在免疫组分析中,对免疫T细胞群体V—p组织进行分析是研究健康和疾病免疫应答反应的重要手段。利用FQ—PCR技术进行分析,克服了原来分析方法如流式细胞法、竞争性PCR技术等操作复杂,准确性低,污染严重的缺点。

      4 结语

      综上所述,FQ—PCR作为一种核酸定量技术,在以前的PCR技术上得到进一步发展,大大降低了假阳性率,工作效率高,结果重现性好,且不必使用对人体有害的染色剂。FQ—PCR应用较多且较成熟主要是在病原体检测方面,其优越性在此也得以充分体现。因此将其应用于临床具有很大潜力。在肿瘤、遗传病研究,尤其是基因表达方面的研究,该技术应用还较少,在这方面加强研究应用,将会有广阔的前景。将生物基因芯片技术与FQ—PCR技术结合,有助于PCR技术的进一步完善,推动该技术的发展、应用。

  • SGS声学实验室助力解决噪音问题

    SGS材料测试 发布于 2022-08-16 11:07:07

    轰隆隆的施工声、楼下的熙攘声、汽车的轰鸣声,日益壮大的广场舞队伍夜夜笙歌……

    生活中,即使已经满身疲惫地躺在床上,但被噪音“骚扰”迟迟无法入眠。这样的情况有不少人正在经历,有的已成为习惯,但更多的是无可奈何。

    我们所处的环境,噪音污染有多严重?分贝超标的声音对身体伤害有多深?

    不同噪声分贝大小人耳的感受

    分贝值(dB)

    普通人听觉感受

    0~20

    很静、几乎感觉不到

    20~40

    安静、犹如轻声絮语

    40~60

    一般、普通室内谈话

    60~70

    吵闹、有损神经

    70~90

    很吵、神经细胞受到破坏

    90~100

    吵闹加剧、听力受损

    100~120

    难以忍受、呆一分钟即暂时致聋

    大于120

    极度聋或全聋

     

     噪音是发声体做无规则振动时发出的声音,波形是杂乱、非周期性的噪声对人们是一种危害,它不仅会降低人的生活质量,影响工作和学习效率,还会对人的听力造成损伤,一旦听力受到损伤,则永远不会复原。

    面对如此明显的伤害,一味地躲避解决不了问题,重要的是防噪措施必须到位。
    隔绝噪音对生活的污染,一要隔绝建筑物外部噪音,如汽笛声,主要手段则是安装隔声性能良好的门窗产品,阻止噪音传播到室内。二是降低建筑物内部噪音,如房间与房间间的活动声,上下楼层之前的走动声等,主要改善措施是选择吸音性能良好的吊顶系统、隔声性能良好的室内门以及撞击声改善效果良好的地板等建筑装修材料。

    SGS作为国际公认的检验、鉴定、测试和认证机构,顺应市场需求,在常州建立了由混响室、空气声隔声实验室和撞击声隔声实验室组成的声学实验室。可以提供建筑材料吸音系数、门窗隔声性能以及地板撞击声改善性能检测。

     

    测试介绍

    吸声性能测试

    测试将使您更好地了解各种材料的吸声特性,以便利用已知吸声特性的材料和结构,控制建筑物内的噪声,或者创造较为理想的声学环境。


    空气声隔声测试

    测试会让您充分了解各类建筑构件的隔声性能,使用合适的隔声构件,在保证室内环境的私密性的同时,降低外界噪声对室内的影响。

     

    撞击声隔声测试

    测试可以评估当楼板、楼板覆盖物和吊顶系统在受到上层固体物体撞击时对下层空间产生的撞击声影响。现实中商务楼宇和多层住宅中的休息空间对这一特性尤为看重。

    服务范围

    测试参数

    测试标准

    适用范围

    吸声系数

    GB/T 20247-2006

    ISO 354:2003

    ASTM C423-17

    玻璃棉、岩棉、聚苯乙烯泡沫、吸声窗帘各类吸声材料及建筑构件等

    空气声隔声

    传声损失STC

    GB/T 19889.3-2015

    GB/T 8485-2008

    ISO 10140-2:2010

    ASTM E90-09

    石膏板、隔声窗、隔声门、隔声墙、声屏障等隔声构件

    撞击声隔声

    撞击声隔声等级

    GB/T 19889.6-2005

    ISO 10140-3:2010

    ASTM E492-09

    天花吊顶、隔声垫、减震垫、地板、地毯及各种铺地隔声减震材料等

    撞击声隔声改善量

    GB/T 19889.8-2006

    ISO 10140-3:2010

    ASTM E2179-03(2016)

      

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    kcyiqi18 发布于 2021-08-12 17:40:15

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  • 2019秋季中国高等教育博览会11月01至03

    kmkeqing 发布于 2019-10-31 14:18:16






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  • 一文读懂什么是IND、NDA、ANDA

    medicilon 发布于 2018-09-11 15:20:17

    FDA新药审评程序包括新药临床试验申请IND申报和新药申请NDA申报两个过程,申请人在完成新药临床前研究后,便可向FDA提出IND申请,若FDA在收到后30天内未提出反对意见,申请人便可自行开展新药临床研究。仿制药申请通常被认为是简短的,因为这类申请不需要提供临床前动物和临床人体数据来证明其安全性和有效性。下面来看一下什么是IND申报、NDA申报和ANDA申报?

    1IND申报

    IND主要目的是提供足够信息来证明药品在人体进行试验是安全的,以及证明针对研究目的的临床方案设计是合理的。IND主要包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期临床试验申请,其中Ⅰ、Ⅱ期临床试验为初期临床试验,是疗效的探索阶段;Ⅲ期临床试验为扩大临床试验,是疗效的验证性阶段,只有在初期临床试验IND获准后,申请人才可以提交扩大临床试验申请。

    美迪西临床注册(IND)申报服务平台深入了解中国和美国法规政策环境以及其对化药的技术要求,能为国内客户提供CFDAIND申报,USFDAIND/ANDA申报服务;能为国外客户提供CFDAIND/ANDA申报服务。美迪西临床注册申报平台的服务对象不仅包括在美迪西做整套临床前研究的客户,还包括有单独临床注册申报需求的药界同行。

    IND申报阶段,FDA一般规定(最低限度)药品申办者必须:(1)做该药的药理研究;(2)在至少二种动物身上进行急毒试验;(3)按照该药预想的用途进行为期二个星期至三个月的短期研究。一旦临床前研究结束,动物试验并没有结束随之完成,许多时间更长、更专项的研究如慢性、抗癌试验将在整个新药申请过程中进行。

    临床前研究用来评估: 1)药品的药理学现象和作用机理(MOA);(2)药物毒性特征和毒性靶器官;(3)药物吸收、分布、代谢和排泄(ADME)。当药品申办者认为它已具有足够的数据证明该药是安全时,就可准备向FDA提交新药临床研究申请(IND)。本质上IND只是一个建议,通过这个建议,药品申办者获得FDA的许可,开始在人身上进行试验。

    2NDA申报

    当人体试验第三阶段完成,所需非临床试验已告结束,则可以出具一套资料,向FNS申请新药上市许可之核准,NDA主要目的是确保上市药品安全有效和质量可控。以植物药NDA为例,FDA认为除其在质量标准方面与化学药品确有不同之外,在安全性和有效性方面二者应符合相同上市标准。因此FND对植物药NDA在安全性和有效性方面的审批要求与相同适应证的化学药品相同,但在质量标准方面可有所不同。

    植物药NDA申报材料与化学药品类似,主要包括以下内容:CMC数据、非临床药理和毒理数据、人体药代动力学和生物利用度数据、微生物数据、临床数据、安全性数据更新报告、统计学数据、病例报告表、有关专利情况、样品、包装及标签等。

    一般符合以下情况均可向FDA提出NDA申请:

    1)新分子实体 (NME)  

    2)新化学实体(NCE);  

    3)原批准药品相同化学成分的新盐基、新酯基; 

    4)原批准药品的新配方组成;

    5)原批准药品的新适应症(包括处方药转非处方药使用);

    6)新剂型、新给药途径、新规格(单位含量); 

    7)两种以上原批准药品的新组合。  

    3ANDA申报

    ANDA的申请即为“复制”一个已被批准上市的产品。其中,这里的“复制”是指其与该上市药品具有相同的活性成分、剂型、规格、服用方式及适应症等。仿制药申请被称为简短的 (abbreviated),是因为这类申请不需要提供临床前(动物)和临床(人体)数据来证明其安全性和有效性。取而代之的是,仿制药申请者必需提供产品生物等效性的证明材料(比如与原研药相比没有区别)。一旦此类药品获得批准,申请者可以生产并上市这一安全有效且价格低廉的替代物。

    BE试验是为了比较仿制药和原研药体内吸收程度和吸收速率,因此提供源于BE试验的数据是ANDA申报资料中一个关键的组成部分。与评估药学等效性一起,确立生物等效性允许在药政监管层面上做出治疗等效性的结论。

     

     

  • 如何在博文中上传图片?

    百科向导 发布于 2007-09-13 14:30:04

    在博文中,上传图片分三步走:

    一、处理图片

    博文中上传的图片只允许:.jpg .gif .png格式

    如果您手头的图片不是以上格式(比如.bmp或位图等),请先用图片处理工具(如piccsa或photoshop)处理成分辨率中等的、.jpg或.gif文件再上传。

    二、上传图片

    点击图1红框所示“Browse”按钮,从本地计算机选择一个您处理好的图片。然后点击“上传”,等待几秒钟。

    图1 上传图片或文件

    上传后,文件被显示在上传操作界面的上方,如图2所示,表明文件已经成功地上传到网站上。

    图2 上传成功后的页面和“插入”操作

    您也可以选择“批量上传”一次上传多个图片。方法是点击“批量上传”,然后从本地计算机选择多个您处理好的图片。选择完毕,然后点击“上传”,等待几秒钟,就可以一次上传多个图片了。

    如果被上传的文件不在您本地计算机上,而在互联网的其它网站上,您也可以选择“远程上传”。

    三、插入到博文中

    这时,您需要把图片插入到日志正文中,请移动滑鼠,让光标停在您想插入图片或文件的位置,然后点击如图2所示的“插入”。等待几秒钟,图片就显示在您需要插入的位置。


    比如:我们需要让上传的图片(“GCMS分析食品药品.jpg”)处于第一行文字“液质联用常常让人头痛,因为种类太多,让人无从选择。”和第二行文字“液质联用的设计,也充分体现了只有想不到、没有做不到的设计思想。”之间,首先,让鼠标光标停留在两行文字之间,然后点击“插入”,这时,图片就显示在两行文字之间了。

    图3 上传成功后的页面和“插入”操作


    说明:插入这一步非常关键,很多网友问:为什么我上传的图片不能显示?

    这就是因为:您上传后没有插入图片到博文中。

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  • 建立时间: 2023-02-21
  • 更新时间: 2023-02-21

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