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宏病毒组测序

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参考报价: 面议 型号: 宏病毒组测序
品牌: 凌恩生物 产地: 上海
关注度: 53 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。高通量测序技术突破了传统技术方法的局限,可以直接以标本中所有的遗传物质为研究对象,从而能够快速地鉴定出标本中存在的病毒,形成了一门研究特定环境中病毒群落的新兴学科:病毒宏基因组学(宏病毒组)

传统意义上有很多用于发现新病毒的方法,如病毒分离、核酸检验、血清学试验等,但它们都有一定的局限性。但利用高通量测序发现新病毒具有信息量大、对标本所含信息无偏倚、操作较简单、检测成本较低等独特优点,使得该技术已成为目前病毒发现中最为重要的技术之一,其在病毒诊断、溯源、预警等方面具有实用意义。

病毒宏基因组测序,又叫宏病毒组测序(Virome),是直接以环境样本中所有病毒的遗传物质为研究对象,记性病毒分析生物学检测的技术,能够快速准确的鉴定出环境中所有病毒的组成,在病毒发现、病毒溯源、微生物预警研究等方面有重要作用。

2018年,全球病毒组计划 (The Global Virome Project) 启动,旨在鉴定出地球上大部分未知病毒。丰富病毒参考数据库如NCBI、JGI,构建新的海洋病毒数据库(GOV)。病毒组序列鉴定分类,对于研究病毒与宿主功能互作意义重大!


技术流程


71.png



分析策略


72.png


应用范围

  • 直接或间接参与地球生物化学循环;

  • 调控寄主群落结构;

  • 病毒与寄主共进化推动地球生态系统的多样性;


宏病毒样本类型及要求

Sample type

Volume or weight

Range of nucleic isolation (ng)

Seawater DNA viruses

100 liter

20-200

Human feces DNA viruses

500 g

500-3,000

Human feces RNA viruses

500 g

140-500

Marine sediments DNA viruses

1 g

50-100

Microbiolites DNA viruses

1 g

50-100

Coral tissue DNA viruses

1 g

60-100

分析示例


73.png

多样本物种分布条形图



74.png

相关性heatmap图


75.png

多样本RDA/CCA分析


76.png

STAMP 分析(样本间)


宏病毒组测序信息由上海凌恩生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于宏病毒组测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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