BSA混池测序

混池测序——即混合群体分离分析法（Bulked Segregant Analysis, BSA），是利用极端性状个体混池进行目标性状基因定位的一种快捷方法。在分离群体中，选取极端性状的子代DNA等量混合，对混合的“基因池”（GenePool）及亲本分别进行建库测序，计算不同文库的测序数据在多态位点（SNP）的频率（Allele Frequency，AF），与目标表型进行关联，从而实现目标性状相关的基因定位或者连锁分子标记的开发。

分析原理

技术优势

1. 大型动植物基因组分析经验丰富，深入挖掘生物群体意义；

2. 流程优化，项目周期显著降低；

3. 结合公共数据库样品信息联合分析，节省成本；

4. 提供基因组数据构建服务，让数据后期利用更加便利。

送样要求

• DNA总量≥500ng，浓度≥12ng/μl，无降解，无粘稠/颜色异常，无RNA /蛋白质污染；

• 使用无DNase管，标记清晰，干冰寄送。

分析示例

标题

与油菜多角果性状相关的基因组区域鉴定

研究背景

油菜（Brassica napus L.）突变体增加了每株植物的角果数目，但其分子机制仍不清楚。本研究结合BSA和全基因组重新测序（WGR）技术，使用来自近等基因系（NILs）zws-ms和zws-217研究与油菜多角果性状相关的基因组区域。

研究结果

1、遗传分析获得了与油菜多角果性状相关的3个SNP和2个InDel。

2、基于功能注释的结果，筛选鉴定出与油菜多角果性状相关的基因组区域和候选基因。

1. Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus. BMC Genomics, 2019.

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